| 辣椒HD-Zip转录因子家族鉴定与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 陈国梁,高瑜,张昊,王亚洁,王睿,王延峰.辣椒HD-Zip转录因子家族鉴定与生物信息学分析[J].分子植物育种,2020(10):3150-3158. |
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| 作者姓名： | 陈国梁 高瑜 张昊 王亚洁 王睿 王延峰 |
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| 作者单位： | 延安大学生命科学学院;延安大学 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31751005);陕西省科技厅农业科技创新与攻关项目(2016NY-138);陕西省红枣重点实验室专项(2003-202990432);延安市农业攻关项目(2017KN-06);延安大学大学生创新训练计划项目(D2018074);延安大学产学研合作培育项目共同资助。 |
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| 摘 要： | 从辣椒基因组数据库中鉴定HD-Zip转录因子,并对其进行生物信息学分析。对鉴定到的转录因子的基本理化性质、染色体定位、系统进化、保守基序和基因结构进行分析。共鉴定到45个辣椒HD-Zip转录因子;该家族成员均含有高度保守的HD-Zip结构域;45个HD-Zip基因以不均匀的方式分布在12条染色体上。根据拟南芥HD-Zip家族分类关系,在结合辣椒HD-Zip基因结构的特点分为GroupⅠ、GroupⅡ、GroupⅢ和GroupⅣ。辣椒HD-Zip转录因子在同一亚族中含有相同的保守基序和基因结构。本研究初步明确了辣椒HD-Zip转录因子家族成员进化关系和结构特点,为进一步研究辣椒HD-Zip转录因子家族的系统发育以及生物学功能提供了依据,为辣椒的分子育种提供科学依据。
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| 关 键 词： | 辣椒(Capsicum annum L.) HD-ZIP 转录因子 生物信息学 |
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