菜心光敏色素B基因BcPHYB的鉴定与分析

菜心在长日照或短日照条件下均可抽薹开花,为解释菜心开花对光周期不敏感的分子机制,本研究以‘四九菜心’为材料,利用菜心叶片转录组测序数据鉴定了光敏色素B基因(BcPHYB)。通过构建系统树,发现菜心BcPHYB类似于早花大白菜BraPHYB2,并且在5’UTR中存在20 bp的InDel。菜心BcPHYB在pre-mRNA加工中存在着选择性剪接,一部分转录本会保留1号、2号或3号内含子,导致相应的BcPHYB蛋白产物中插入或者缺失部分氨基酸序列片段。本研究分析了菜心BcPHYB的InDel变异与选择性剪接情况,为阐释菜心对光周期不敏感的开花分子机制提供了帮助。