| 菜豆TIFY基因的全基因组鉴定与系统进化分析 |
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| 引用本文： | 胡利宗,李超琼,张雯露,王雪芹,刘红占,纪秀娥.菜豆TIFY基因的全基因组鉴定与系统进化分析[J].分子植物育种,2020(10):3132-3140. |
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| 作者姓名： | 胡利宗 李超琼 张雯露 王雪芹 刘红占 纪秀娥 |
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| 作者单位： | 周口师范学院生命科学与农学学院;周口师范学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31500534);河南省科技攻关计划项目(172102110169);河南省教育厅项目(18A1800-09);周口师范学院2017年校级骨干教师资助项目(ZKNU201708);周口师范学院2016年度科研创新基金项目(zknuA201602)。 |
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| 摘 要： | TIFY蛋白是植物特异性转录因子,在植物生长、发育和基因调控中具有重要作用。尽管部分菜豆TIFY基因被鉴定与研究,但从基因组水平剖析TIFY基因家族的研究未见报道。结合基因组和转录组学数据,本研究系统剖析了菜豆TIFY基因家族的序列、选择、表达及进化特征。结果显示:18个PvTIFY基因散落分布在9条染色体上,共线性鉴定出6对片段重复基因和1对串联重复基因,同时这些基因被分为6大类群;序列分析表明,菜豆TIFY基因有12种基因结构模式,但有5种保守基序组成模式,这说明保守基序模式更保守;选择压力检测显示,同源基因对均受到负选择作用,显示较高的保守性;表达分析揭示了菜豆TIFY家族基因具有多样化的表达模式,其中同源基因对表达模式发生趋异现象。这些结果为深入研究菜豆TIFY蛋白的生理功能提供了参考。
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| 关 键 词： | 菜豆 TIFY 基因 基因组 系统进化 |
Genome-wide Identification and Phylogenetic Analysis of the TIFY Genes in Common Bean(Phaseolus vulgaris) |
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| Hu Lizong,Li Chaoqiong,ZhangWenlu,Wang Xueqin,Liu Hongzhan,Ji Xiue.Genome-wide Identification and Phylogenetic Analysis of the TIFY Genes in Common Bean(Phaseolus vulgaris)[J].Molecular Plant Breeding,2020(10):3132-3140. |
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| Authors: | Hu Lizong Li Chaoqiong ZhangWenlu Wang Xueqin Liu Hongzhan Ji Xiue |
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| Institution: | (College of Life Science and Agriculture,Zhoukou Normal University,Zhoukou,466001;Henan Key Laboratory of Crop Molecular Breeding&Bioreactor,Zhoukou Normal University,Zhoukou,466001) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Common bean TIFY gene Genome Phylogeny |
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