| 星油藤WOX基因家族成员的鉴定及其表达谱分析 |
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| 引用本文： | 郭亚静,付乾堂,胡晓笛,陈茂盛,潘帮珍,陶彦彬,何惠英,徐增富. 星油藤WOX基因家族成员的鉴定及其表达谱分析[J]. 分子植物育种, 2020, 0(12): 3907-3915 |
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| 作者姓名： | 郭亚静 付乾堂 胡晓笛 陈茂盛 潘帮珍 陶彦彬 何惠英 徐增富 |
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| 作者单位： | 中国科学院西双版纳热带植物园;中国科学院大学生命科学学院 |
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| 基金项目： | 云南省自然科学基金(2014FB186,2016FB051);中国科学院西双版纳热带植物园一三五项目(2017XTBG-T02)共同资助。 |
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| 摘 要： | 本研究利用星油藤(Plukenetia volubilis L.)转录组及基因组数据库,通过本地BLAST,筛选到了9个星油藤WOX(PvoWOX)基因家族成员,并对它们编码的蛋白质氨基酸序列、分子量和等电点等进行了预测。通过构建系统进化树,将该基因家族成员分为3个进化支,分别为远古支、中间支和WUS支;进一步对PvoWOX家族成员的基因结构和蛋白保守结构域分析发现在同一进化支中均很保守,并且家族成员均含有保守的同源异型结构域,其中WUS支的成员都含有WUS-box结构域。利用转录组数据和qRT-PCR对PvoWOX基因家族成员在星油藤不同器官中的表达谱进行了分析,结果显示9个PvoWOX基因成员具有不同的表达模式,其中WUS支和中间支成员的表达具有组织特异性,而远古支成员则在不同的器官中均有表达。因此推测PvoWOX家族成员具有功能多样性,分别参与调控星油藤不同器官的发育过程。本研究结果为进一步研究PvoWOX的生物学功能提供了帮助。
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| 关 键 词： | 星油藤(Plukenetia volubilis) WOX基因家族 生物信息学分析 表达分析 |
Identification and Expression Analysis of WOX Family Genes in Sacha Inchi(Plukenetia volubilis) |
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| Guo Yajing,Fu Qiantang,Hu Xiaodi,Chen Maosheng,Pan Bangzhen,Tao Yanbin,He Huiying,Xu Zengfu. Identification and Expression Analysis of WOX Family Genes in Sacha Inchi(Plukenetia volubilis)[J]. Molecular Plant Breeding, 2020, 0(12): 3907-3915 |
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| Authors: | Guo Yajing Fu Qiantang Hu Xiaodi Chen Maosheng Pan Bangzhen Tao Yanbin He Huiying Xu Zengfu |
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| Affiliation: | (CAS Key Laboratory of Tropical Plant Resources and Sustainable Use,The Innovative Academy of Seed Design,Xishuangbanna Tropical Botanical Garden,Chinese Academy of Sciences,Mengla,666303;College of Life Sciences,University of Chinese Academy of Sciences,Beijing,100049) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Sacha Inchi(Plukenetia volubilis) WOX gene family Bioinformatics analysis Expression analysis |
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