| 紫竹PPO基因的生物信息学及表达分析 |
| |
| 引用本文： | 关鹰,王弋,郭小勤,林新春,方伟. 紫竹PPO基因的生物信息学及表达分析[J]. 浙江林业科技, 2013, 33(2) |
| |
| 作者姓名： | 关鹰 王弋 郭小勤 林新春 方伟 |
| |
| 作者单位： | 浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培育基地,浙江临安,311300 |
| |
| 基金项目： | 浙江农林大学科研发展基金面上项目,浙江省科技厅 |
| |
| 摘 要： | 以紫竹(Phyllostachys nigra)一年紫嫩叶的cDNA为材料获得一个多酚氧化酶基因(命名为PnPPO1)片段,测序显示,该序列长438 bp,该片段编码有146个氨基酸残基组成的多酚氧化酶保守区,该区域包含CuB结合区,其编码的蛋白属于酪氨酸酶(tyrosinase).Blastp分析显示,该氨基酸序列与小麦(Triticum aestiv)、水稻(Oryza sativa)中的多酚氧化酶有很高的同源性.该蛋白片段分子量约为36.2 kD,pI为5.03.比对一年紫和台湾紫中该基因的序列发现,两者同源性为84.45％,两者间还存在明显的SNP位点会导致酶切点位发生变化和新酶切位点的产生.RT-PCR分析结果表明,PnPPO1基因在叶芽中表达最高,鞭根中微量表达,其余供试组织中未检测到其表达.
|
| 关 键 词： | 紫竹 PPO基因 多酚氧化酶 单核苷酸多态性 |
Bioinformatic Analysis and Expression of PPO Gene in Phyllostachys nigra |
| |
| GUAN Ying , WANG Yi , GUO Xiao-qin , LIN Xin-chun , FANG Wei. Bioinformatic Analysis and Expression of PPO Gene in Phyllostachys nigra[J]. Journal of Zhejiang Forestry Science and Technology, 2013, 33(2) |
| |
| Authors: | GUAN Ying WANG Yi GUO Xiao-qin LIN Xin-chun FANG Wei |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | Phyllostachys nigra PPO gene polyphenol oxidase SNP |
| 本文献已被 万方数据 等数据库收录！ |
|
