转录组的黄山栾树MYB基因家族鉴定及表达 |
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引用本文: | 吕运舟,董筱昀,梁珍海,孙海楠,黄利斌,蒋泽平.转录组的黄山栾树MYB基因家族鉴定及表达[J].东北林业大学学报,2021,49(4):33-38. |
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作者姓名: | 吕运舟 董筱昀 梁珍海 孙海楠 黄利斌 蒋泽平 |
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作者单位: | 江苏省林业科学研究院,南京,211153 |
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基金项目: | 江苏省科技厅青年基金(BK20141041)。 |
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摘 要: | 植物叶片颜色是有色素组成、含量及分布动态决定,MYB转录因子在这一生物过程中发挥重要作用。为了揭示黄山栾树黄叶突变体‘金焰彩栾’叶片呈色的转录调控机制,依据转录组数据,通过挖掘MYB转录因子和生物信息学分析,结合不同组织表达对其功能进行分析。结果表明:从黄山栾树转录组共鉴定97个MYB转录因子,预测编码蛋白质所含氨基酸数目52~1 780个,分子质量大小52.0~193.35 ku。序列比对及进化分析发现,黄山栾树MYB基因与拟南芥MYB基因聚为23个亚家族,预测分别参与次生代谢、生长发育和胁迫响应等过程。结合表达特征分析,预测KbMYB80、KbMYB91、KbMYB6、KbMYB8和KbMYB40可能参与黄酮和花青素的生物合成调控,KbMYB60负调控花青素生物合成,KbMYB16和KbMYB88参与黄山栾树叶片细胞次生壁合成过程。
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关 键 词: | 黄山栾树 MYB转录因子 基因家族 色素 |
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