| Cyt b和12S rRNA基因进化速度对构建系统进化树的影响 |
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| 引用本文： | 王利利,彭建军,于冬梅,胡诗佳,高赛飞,傅美兰,刘曦庆.Cyt b和12S rRNA基因进化速度对构建系统进化树的影响[J].安徽农业科学,2011,39(9):5101-5103,5106. |
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| 作者姓名： | 王利利 彭建军 于冬梅 胡诗佳 高赛飞 傅美兰 刘曦庆 |
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| 作者单位： | 华南濒危动物研究所物种鉴定中心,广东广州,510260;华南濒危动物研究所物种鉴定中心,广东广州,510260;华南濒危动物研究所物种鉴定中心,广东广州,510260;华南濒危动物研究所物种鉴定中心,广东广州,510260;华南濒危动物研究所物种鉴定中心,广东广州,510260;华南濒危动物研究所物种鉴定中心,广东广州,510260;华南濒危动物研究所物种鉴定中心,广东广州,510260 |
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| 基金项目： | 广东省自然科学基金项目(9151026001000003); 广东省科学院优秀青年科技人才基金项目(200804); 广东省野生动物保护和利用公共实验室基金项目(200901) |
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| 摘 要： | 目的]论证线粒体Cyt b和12S rRNA基因不同进化速率影响构建的系统树拓扑结构。方法]从GenBank下载了蛇亚目12科15种蛇线粒体全序列,提取Cyt b和12S rRNA基因序列,选用GTR＋I＋G核苷酸替代模型,基于最大似然法,用PAUP4.0软件分别构建2个基因的系统关系树。结果]在选用相同的软件、建树方法和研究物种的情况下,构建的系统树拓扑结构差异主要是因为线粒体Cyt b和12S rRNA基因进化速率不同产生的。结论]在分子系统进化研究中,要针对不同的研究物种和研究目的,选择合适的基因构建系统进化树。
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| 关 键 词： | 系统进化 蛇 Cyt b 12S rRNA 进化速度 |
Effects of Evolution Rate of Cyt b,12S rRNA Genes on Constructing Phylogenetic Trees |
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| WANG Li-li et al.Effects of Evolution Rate of Cyt b,12S rRNA Genes on Constructing Phylogenetic Trees[J].Journal of Anhui Agricultural Sciences,2011,39(9):5101-5103,5106. |
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| Authors: | WANG Li-li |
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| Institution: | WANG Li-li et al(Identification Center for Wildlife Species,South China Institute of Endangered Animals,Guangzhou,Guangdong 510260) |
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| Abstract: | Objective] The aim was to prove that the mitochondrial genes of Cyt b and 12S rRNA with different evolutional rates have effects on the topological structures of phylogenetic trees.Method] The complete sequences of Cyt b and 12S rRNA from 15 species in 12 families of snakes were downloaded and extracted from GenBank,while their molecular phylogenetic trees were constructed by Maximum Likelihood(ML) method with GTR+I+G substitute model based on PAUP4.0 software.Result] With the same software,methods and s... |
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| Keywords: | Molecular phylogeny Snake Cyt b 12S rRNA Evolution rate |
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