| 大豆GmST1基因的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 井妍,孙晶,高赛男,赵雪,滕卫丽,韩英鹏,李文滨.大豆GmST1基因的生物信息学分析[J].大豆科学,2016(3):394-401. |
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| 作者姓名： | 井妍 孙晶 高赛男 赵雪 滕卫丽 韩英鹏 李文滨 |
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| 作者单位： | 东北农业大学农学院/大豆生物学教育部重点实验室/东北农业大学农业部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室,黑龙江哈尔滨,150030 |
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| 基金项目： | 国家现代农业产业技术体系(CARS-04-PS04)，国家自然科学基金(31301339)，黑龙江省教育厅科学技术研究项目(12541049)，黑龙江省普通高等学校新世纪优秀人才培养计划(1253-NCET-005). |
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| 摘 要： | 磺基转移酶(sulfotransferase,SULT)基因是一个基因超家族。对大豆磺基转移酶基因GmST1(Glyma.13G191400)进行基于生物信息学的基因结构分析与功能预测,结果表明:GmST1(Williams82)基因序列全长1 439 bp,CDS区长1 035 bp,编码344个氨基酸。通过序列比对,分析出在感病Williams 82和抗病品种东农93-046中,GmST1序列存在着非同义SNP,导致氨基酸改变。利用Plant CARE分析启动子元件,发现在基因启动子序列中含有多个与光诱导、生长素、水杨酸、干旱等相关的元件。在BAR数据库中分析了GmST1的拟南芥同源基因在不同逆境胁迫条件下基因表达情况,表明该基因表达具有组织表达特异性,参与盐胁迫、干旱胁迫和抗病等相关反应。
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| 关 键 词： | 大豆 GmST1 磺基转移酶 蛋白质结构分析 功能预测 |
Bioinformatics Analysis of ST1 Gene in Soybean |
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| Keywords: | Soybean GmST1 SULT Protein structure analysis Functional prediction |
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