大豆异黄酮还原酶基因的鉴定及生物信息学分析 |
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引用本文: | 张古文,刘娜,冯志娟,徐盛春,胡齐赞,龚亚明. 大豆异黄酮还原酶基因的鉴定及生物信息学分析[J]. 大豆科学, 2016, 0(6): 911-918. DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2016.06.0911 |
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作者姓名: | 张古文 刘娜 冯志娟 徐盛春 胡齐赞 龚亚明 |
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作者单位: | 浙江省农业科学院蔬菜研究所,浙江杭州,310021 |
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基金项目: | 浙江省重大科技专项(2012C12903-4-1),浙江省植物有害生物防控重点实验室—省部共建国家重点实验室培育基地项目(2010DS700124-KF1611),浙江省公益技术应用研究计划项目(2015C32050). |
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摘 要: | 异黄酮是大豆生长过程中形成的一类次级代谢产物,是大豆主要的功能活性成分之一。异黄酮还原酶(isoflavone reductase,IFR)是异黄酮分解途径的关键酶之一,在调控异黄酮含量及成分方面起着重要作用。本研究基于大豆全基因组测序数据,利用生物信息学方法鉴定了大豆异黄酮还原酶基因家族成员,并对其基因的序列特征、结构特征和遗传多样性进行了分析。结果表明:大豆异黄酮还原酶(GmIFR)家族含有17个成员,蛋白序列介于191(GmIFR07)和376(GmIFR11)个氨基酸之间,序列相似性为19.59%(Gm IFR07和GmIFR11)~98.43%(Gm IFR12和GmIFR17),结构分析表明这些基因内含子数目差异较大,2~6个不等,不均匀的分布在大豆的1、4、6、9、11、12和16号染色体上。
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关 键 词: | 大豆 异黄酮 异黄酮还原酶 基因家族 |
Identification and Bioinformatics Analysis of Isoflavone Reductase Genes in Soybean |
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Abstract: | |
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Keywords: | Soybean Isoflavone Isoflavone reductase Gene family |
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