| 甜菜EST-SSR引物的开发与应用 |
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| 引用本文： | 史树德,魏磊,张子义,邵金旺,田自华.甜菜EST-SSR引物的开发与应用[J].中国糖料,2011(3). |
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| 作者姓名： | 史树德 魏磊 张子义 邵金旺 田自华 |
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| 作者单位： | 内蒙古农业大学农学院;内蒙古农业大学生命科学院;内蒙古农业大学甜菜生理研究所; |
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| 基金项目： | 国家甜菜产业技术体系(CARS-210402); 内蒙古自治区高等学校科学研究项目(NJzy08045) |
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| 摘 要： | 利用NCBI公共数据库现有的甜菜(Beta vulgaris L.)表达序列标签(expressed sequence tags,EST)数据信息,开发了甜菜EST-SSR标记。在所有的29830条甜菜EST序列中共确认得到20109条非冗余EST序列,总长为11287.6kb。在含有微卫星重复的6951条EST序列中按照SSR引物设计要求,最终获得了2845个EST-SSR,平均每3.96 kb含有1个SSR。EST-SSR的分布频率和特征分析表明,A/T单碱基重复最多,其次是AAG/CTT三核苷酸重复,AG/CT二核苷酸重复,ACCTCC/AGGTGG等六核苷酸重复最少。随机合成了100对SSR引物,并分别选用6个甜菜品种进行多态性检验,将其按遗传相似性分为两组,多态信息含量(polymorphism information content,PIC)平均值为0.47。本研究证实这种全新的开发甜菜SSR标记的方法具有高效、多态性较高的特点,在甜菜遗传多样性分析、功能基因定位、遗传图谱构建以及比较基因组等研究方面有广阔的利用前景。
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| 关 键 词： | 甜菜 微卫星 表达序列标签 遗传多样性 |
Development and Utilization of EST-SSR Marker in Sugarbeet(Beta vulgaris L.) |
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| SHI Shu-de,WEI Lei,ZHANG Zi-yi,SHAO Jin-wang,TIAN Zi-hua.Development and Utilization of EST-SSR Marker in Sugarbeet(Beta vulgaris L.)[J].Sugar Crops of China,2011(3). |
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| Authors: | SHI Shu-de WEI Lei ZHANG Zi-yi SHAO Jin-wang TIAN Zi-hua |
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| Institution: | SHI Shu-de1,WEI Lei1,ZHANG Zi-yi2,SHAO Jin-wang3,TIAN Zi-hua1(1.College of Agronomy,Inner Mongolia Agricultural University,Huhhot 010019,China,2.College of Life Sciences,Huhhot 010018,China 3.Institute of Sugarbeet Physiology,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | sugarbeet expressed sequence tags(ESTs) microsatellites(SSRs) genetic diversity |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ |
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