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鸭肝炎病毒浙江分离株全基因组测序及其VP1基因的序列分析
引用本文:邵泽香,韦强,鲍国连,崔言顺,刘燕,王春平,季权安,李建亮. 鸭肝炎病毒浙江分离株全基因组测序及其VP1基因的序列分析[J]. 中国兽医学报, 2010, 30(8)
作者姓名:邵泽香  韦强  鲍国连  崔言顺  刘燕  王春平  季权安  李建亮
作者单位:1. 浙江省农业科学院畜牧兽医研究所,浙江,杭州,310021;山东农业大学,动物科技学院,山东,泰安,271018
2. 山东农业大学,动物科技学院,山东,泰安,271018
3. 浙江省农业科学院畜牧兽医研究所,浙江,杭州,310021
基金项目:长三角重点资助项目,浙江省自然科学基金
摘    要:利用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)技术及RACE方法扩增得到鸭肝炎病毒(DHV)浙江分离株Z10的全基因(5',3'末端序列用RACE法扩增)及4株DHV分离株的VP1基因.结果表明,分离株Z10的全基因片段长7689 bp,有1个大的开放读码框(ORF),ORF位于626~7326位核苷酸,编码2249个氨基酸.Z10分离株全基因序列与GenBank登录的6株具有代表性的DHV核苷酸序列比对,同源性94.5%~98.4%;所测得的DHV分离株的VP1基因的序列与目前GenBank上发表的具有代表性的DHv-Ⅰ VP1基因进行比对分析,结果4株Ⅰ型DHV的VP1基因cDNA长度均为714 bp,编码238个氨基酸.4株DHV-Ⅰ之间VP1基因的核苷酸序列同源性为93%~99.7%,氨基酸序列同源性为95.0%~100%;与参考毒株VP1基因的核苷酸序列同源性为92.2%~100%,氨基酸序列同源性为95.0%~100%;表明各分离毒株的亲缘关系较近,属于同一基因群.

关 键 词:Ⅰ型鸭肝炎病毒  VP1基因  RT-PCR  序列分析

Sequence analysis of duck hepatitis virus whole genome and VP1 gene of four strains of duck hepatitis virus
SHAO Ze-xiang,WEI Qiang,BAO Guo-lian,CUI Yan-shun,LIU Yan,WANG Chun-ping,JI Quan-an,LI Jian-liang. Sequence analysis of duck hepatitis virus whole genome and VP1 gene of four strains of duck hepatitis virus[J]. Chinese Journal of Veterinary Science, 2010, 30(8)
Authors:SHAO Ze-xiang  WEI Qiang  BAO Guo-lian  CUI Yan-shun  LIU Yan  WANG Chun-ping  JI Quan-an  LI Jian-liang
Abstract:
Keywords:
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