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鸽Ⅰ型副黏病毒的分离鉴定及其F基因、HN基因的序列分析
引用本文:陈钟鸣,刘怀然,孙敏华,戴鼎霞,张志成,方光远,孔宪刚.鸽Ⅰ型副黏病毒的分离鉴定及其F基因、HN基因的序列分析[J].中国兽医学报,2010,30(9).
作者姓名:陈钟鸣  刘怀然  孙敏华  戴鼎霞  张志成  方光远  孔宪刚
作者单位:1. 金陵科技学院,动物科学与技术学院,江苏,南京,210038
2. 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所,黑龙江,哈尔滨,150001
基金项目:江苏省自然科学基金项目,国家兽医生物技术重点实验室开发课题基金资助
摘    要:利用RT-PCR技术,将从江苏省分离到的2株鸽源NDV的融合蛋白(F)和血凝素神经氨酸酶(HN)基因重要功能区片段进行扩增和序列分析,发现F蛋白多肽裂解位点的氨基酸序列为112K-R-Q-K-R-F117,符合NDV强毒株序列特点.F基因分型及同源性比较显示,分离到的2株鸽源NDV PG-CH-JS-1-05,PG-CH-JS-1-06属基因Ⅵ型.与国内参考毒株YN-P1 F基因推导的氨基酸序列同源性最高为96.4%,与LaSota的同源性为84.1%~84.2%,与F48E9的同源性为86.0%~86.2%;与国外参考毒株Warwick66的同源性为92.7%~93.3%;HN基因氨基酸序列同源性比较显示,与PB9601的同源性最低,只有3.4%~3.7%,与LaSota的同源性也较低,为88.5 % ~88.7%.而与国外参考毒株IT-227-82的氨基酸序列同源性为95.4%~95.6%,与Pigen-NY-US-1984的同源性为94.8%~94.9%,与248 V B的同源性为92.5%~92.7%,说明与国外鸽源NDV分离毒株的遗传距离较近.

关 键 词:新城疫病毒  F基因  HN基因  基因型  

Genetic variation and genotype of F gene of paramyxovirus isolates originated from pigeons
CHEN Zhong-ming,LIU Huai-ran,SUN Min-hua,DAI Ding-xia,ZHANG Zhi-cheng,FANG Guang-yuan,KONG Xian-gang.Genetic variation and genotype of F gene of paramyxovirus isolates originated from pigeons[J].Chinese Journal of Veterinary Science,2010,30(9).
Authors:CHEN Zhong-ming  LIU Huai-ran  SUN Min-hua  DAI Ding-xia  ZHANG Zhi-cheng  FANG Guang-yuan  KONG Xian-gang
Abstract:
Keywords:
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