小拟南芥HDG12基因的克隆、生物信息学分析及植物表达载体的构建

以小拟南芥基因组DNA为模板,运用同源克隆法获得小拟南芥HDG12基因,命名为Ap HDG12。运用生物信息学方法,对Ap HDG12基因的理化性质、保守序列、二级结构、亚细胞定位等进行了分析,并进行同源建模。经测序和生物信息学软件预测分析,结果显示,Ap HDG12基因由10个外显子和9个内含子组成,mRNA长度为2 064 bp,编码687个氨基酸,亚细胞定位于细胞核。系统进化树显示Ap HDG12与Capsella rubella遗传距离最近,CDD保守序列分析结果显示Ap HDG12有18~79位的同源异型域和206~436位的START结构域,属于HD-zipⅣ类基因家族,同时构建了植物表达载体p BI121::HDG12,转化到农杆菌GV3101中,为进一步研究基因功能奠定基础。