藏鸡与白羽肉鸡垂体转录组差异表达研究 |
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引用本文: | 王宏玲,王英明,梁城,唐慧,李志雄,吴锦波.藏鸡与白羽肉鸡垂体转录组差异表达研究[J].中国畜牧兽医,2021,48(6):1939-1947. |
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作者姓名: | 王宏玲 王英明 梁城 唐慧 李志雄 吴锦波 |
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作者单位: | 1. 西南民族大学畜牧兽医学院, 成都 610041;2. 西南民族大学青藏高原动物遗传资源保护与利用重点实验室, 成都 610041;3. 阿坝藏族羌族自治州州畜牧科学技术研究所, 阿坝 624402 |
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基金项目: | 四川省科技计划项目(2020YFSY0048);西南民族大学大学生创新训练项目(S201910656153) |
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摘 要: | 试验旨在通过对藏鸡和白羽肉鸡垂体转录组测序和生物信息学分析,筛选出与鸡生长发育相关的差异表达基因(differentially expression genes,DEGs)及信号通路。本研究选用42日龄健康藏鸡和白羽肉鸡各3只,分别采集垂体组织利用Illumina HiSeq 2000平台进行转录组mRNA测序,对筛选到的DEGs筛选DEGs,GO和KEGG数据库功能注释和富集分析,实时荧光定量PCR验证随机挑选的DEGs表达水平。结果显示,藏鸡和白羽肉鸡分别获得126 094 302和125 666 442条clean reads。与白羽肉鸡相比,藏鸡垂体组织中共有DEGs 392个,其中196个为上调基因,196个为下调基因(P<0.05),其中包括生长激素(GH)基因、生长激素释放激素受体(GHRHR)基因和胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白1(IGF2BP1)基因。GO和KEGG富集分析发现,DEGs显著富集于细胞黏附分子信号通路和神经活性配体-受体相互作用信号通路等细胞通讯相关的信号通路,GH、GHRHR和IGF2BP1基因也显著富集于神经活性配体-受体相互作用信号通路。实时荧光定量PCR结果显示,转录组测序结果准确可靠。综上研究,本研究初步揭示了影响藏鸡和白羽肉鸡生长发育速度差异的关键候选基因和信号通路,为了解鸡垂体组织调节生长发育的分子机制提供了理论依据。
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关 键 词: | 藏鸡 白羽肉鸡 转录组测序 垂体 生长发育 |
收稿时间: | 2020-12-20 |
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