银鲳皮肤和肌肉组织的基因表达谱分析 |
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引用本文: | 杨琳琳,蒋燕,杨桂梅,许柳雄,陈新军,徐善良,鲍宝龙.银鲳皮肤和肌肉组织的基因表达谱分析[J].上海水产大学学报,2008,17(4). |
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作者姓名: | 杨琳琳 蒋燕 杨桂梅 许柳雄 陈新军 徐善良 鲍宝龙 |
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作者单位: | [1]上海海洋大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室,上海200090 [2]复旦大学国家重点实验室,上海200090 [3]上海海洋大学海洋科学学院,上海200090 [4]宁波大学生命学院海洋生物工程重点实验室,浙江宁波315211 |
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基金项目: | 上海海洋生物资源与环境创新平台项目
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上海市教委重点学科项目
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上海市教委重点项目 |
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摘 要: | 采用目前国际上最为通用的cDNA文库构建方法,构建了银鲳皮肤和肌肉组织的cDNA文库,通过一定规模的序列测定,并借助生物信息学技术,分析了164个序列,得到了105个不同的基因(或表达序列标签),在105个不同的基因中,68.6%基因没有冗余,1倍、2倍、3倍和4倍冗余的分别占23.8%,3.8%, 2.8%和1%.皮肤和肌肉组织表达基因的组成中,除了21个没有同源序列的未知基因外,可初步归为代谢相关的酶(38个)、DNA有关的酶(7个)、结构蛋白(4个)、膜蛋白(13个)、线粒体蛋白(1个)、转录因子(9个)、信号传导相关的蛋白(10个)和未知蛋白(2个)等8大类,其中,转录因子、膜蛋白,和DNA有关的酶的基因冗余程度相对较高.这些研究结果,为积累银鲳遗传方面的基础信息,了解银鲳皮肤和肌肉组织的基因表达提供了较好的研究基础.
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关 键 词: | 银鲳 基因表达谱 皮肤 肌肉 表达序列标签 |
Gene expression profile in skin and muscle of Pampus argenteus |
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Abstract: | |
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Keywords: | |
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