| 国槐不同器官转录组分析及EST−SSR引物开发应用 |
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| 引用本文： | 郁洁, 徐立人, 庞新博, 等. 国槐不同器官转录组分析及EST−SSR引物开发应用[J]. 西南林业大学学报（自然科学）, 2022, 42(4): 48–58.doi:10.11929/j.swfu.202105010 |
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| 作者姓名： | 郁洁 徐立人 庞新博 刘朝华 李泳潭 原阳晨 董研 |
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| 作者单位： | 1. 河北农业大学林学院，河北 保定 071000;2. 河北省林木种质资源与森林保护重点实验室，河北 保定 071000;3. 河北农业大学园林与旅游学院，河北 保定 071000;4. 河北省洪崖山国有林场，河北 保定 074200 |
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| 摘 要： | 以国槐品种“青云1号”的根、茎、叶3种不同器官为材料，利用高通量测序技术分别对其进行转录组测序，筛选其根、茎、叶差异表达基因，进行生物信息学分析及EST−SSR分析。通过转录组两两对比筛选得到的根 vs. 茎、根 vs. 叶及茎 vs. 叶差异基因数分别为51937、52711和7193条，进一步对其进行GO及KEGG富集分析。结果表明：差异基因显著富集于代谢过程、催化活性、糖酵解和糖质新生等功能。EST−SSR分析表明，国槐根、茎、叶的SSR序列长度均在10～80 bp间变化，主要以10～22 bp的短序列为主，且主要以单核苷酸重复为主，从30对有效性引物中筛选出9对多态性较高的引物，并构建了11个不同国槐无性系的指纹图谱。
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| 关 键 词： | 国槐 转录组 基因 EST−SSR 遗传多样性 |
| 收稿时间： | 2021-05-09 |
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