Quantification of Globodera rostochiensis and G. pallida in mixed populations using species-specific thermostable proteins

A method has been developed to quantify species ratios in mixed populations. The method is based on the separation of species-specific thermostable proteins by SDS-PAGE. Densitometric analyses of the 17 kD protein ofGlobodera pallida and the 18 kD protein ofG. rostochiensis revealed a high correlation (R ²=0.93) with the species ratio in the mixed samples. Within the limits of 10 to 90% of each species, one can estimate with 95% reliability the species composition with 3 to 6% deviation.Samenvatting Een methode is ontwikkeld om de samenstelling van soortenmengsels vanGlobodera rostochiensis enG. pallida te kwantificeren. Bij deze methode wordt gebruik gemaakt van de soort-specifieke thermostabiele eiwitten die met behulp van SDS-PAGE gescheiden worden. De kleurintensiteit van het 17 kD eiwit vanG. pallida en het 18 kD eiwit vanG. rostochiensis is per gel-laan bepaald m.b.v. een densitometer en heeft een lineair verband met de soortsverhouding in de mengsels (R ²=0.93). Binnen het bereik van 10 tot 90% van elke soort kan men met deze ijklijn met 95% betrouwbaarheid de soortsamenstelling bepalen op 3 tot 6% nauwkeurig.