牛源致脑炎大肠杆菌FimD、PilN蛋白的生物信息学分析和优势B细胞表位预测 |
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引用本文: | 海永慧,钦倩,李蓓蓓,任静静,马勋,蒋建军,王鹏雁.牛源致脑炎大肠杆菌FimD、PilN蛋白的生物信息学分析和优势B细胞表位预测[J].中国兽医杂志,2022(3):9-14+2+133. |
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作者姓名: | 海永慧 钦倩 李蓓蓓 任静静 马勋 蒋建军 王鹏雁 |
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作者单位: | 石河子大学动物科技学院 |
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摘 要: | 为了筛选出牛源致脑炎大肠杆菌S9922 FimD、PilN蛋白的优势B细胞表位,本试验采用生物信息学分析工具ProtParam、TMHMM、NetPhos、DNASTAR软件、SOPMA、SWISS-MODEL、BepiPred、Immunomedicine Group等对FimD、PilN蛋白进行理化性质、跨膜区、信号肽、糖基化位点、磷酸化位点、二级结构、三级结构和B细胞表位预测,并进行综合分析,最终得出优势B细胞表位。结果显示,FimD、PilN蛋白都为亲水、稳定蛋白,无规则卷曲在二级结构中所占比例最高;FimD蛋白共有48个磷酸化位点,不存在跨膜区和信号肽;PilN蛋白共有85个磷酸化位点,PilN蛋白在1~50位氨基酸上可能出现跨膜区,26~27位氨基酸上出现信号肽;多种参数综合分析最终得到潜在的优势B细胞表位,FimD蛋白:7~18、144~152、307~315、365~373;PilN蛋白:77~86、138~149、516~524。通过对FimD、PilN蛋白进行综合分析,最终得出潜在的优势B细胞表位,为牛源致脑炎大肠杆菌多表位疫苗的进一步研究提供参考依据。
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关 键 词: | 牛源致脑炎大肠杆菌 FimD蛋白 PilN蛋白 生物信息学分析 B细胞抗原表位 |
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