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基于线粒体控制区分析固始鸡遗传多样性和起源进化
引用本文:顾荣,唐修君,樊艳凤,贾晓旭,葛庆联,陆俊贤,王珏,高玉时. 基于线粒体控制区分析固始鸡遗传多样性和起源进化[J]. 扬州大学学报(农业与生命科学版), 2022, 43(1): 56-61. DOI: 10.16872/j.cnki.1671-4652.2022.01.008
作者姓名:顾荣  唐修君  樊艳凤  贾晓旭  葛庆联  陆俊贤  王珏  高玉时
作者单位:江苏省家禽科学研究所/江苏省家禽遗传育种重点实验室,江苏扬州225125
基金项目:国家自然科学基金;江苏省六大人才高峰项目;江苏省家禽遗传育种重点实验室资助项目
摘    要:为探究固始鸡遗传多样性和母系起源,以73只固始鸡为试验素材,通过PCR扩增和测序技术,获得固始鸡线粒体DNA控制区全序列,并与19条红色原鸡序列构建系统发育树。结果表明:固始鸡mtDNA控制区全长为1 231或1 232 bp, 1 231 bp个体在859 bp处存在C缺失。73只个体共发现15处单核苷酸多态位点,为6种单倍型。遗传多样性分析表明,固始鸡平均核苷酸差异数(K)为5.287,核苷酸多样度(Pi)为0.004 29±0.000 13,单倍型多样度(Hd)为0.600±0.034。系统发育分析显示,6种单倍型可分为A和C 2个分支,A分支与原鸡滇南亚种(Gallus gallus spadiceus)聚为一类,C分支与原鸡印度亚种(Gallus gallus murghi)、原鸡滇南亚种(Gallus gallus spadiceus)、原鸡指名亚种(Gallus gallus gallus)以及原鸡印尼亚种(Gallus gallus bankiva)聚为一类,推测固始鸡可能有多个母系起源。这一研究为从分子水平探究固始鸡遗传资源保护和开发利用提供参考。

关 键 词:固始鸡  线粒体DNA  控制区  遗传多样性  系统进化

Analyses of genetic diversity and phylogenetic evolution of Gushi chicken based on mitochondrial DNA control region sequence
GU Rong,TANG Xiujun,FAN Yanfeng,JIA Xiaoxu,GE Qinglian,LU Junxian,WANG Jue,GAO Yushi. Analyses of genetic diversity and phylogenetic evolution of Gushi chicken based on mitochondrial DNA control region sequence[J]. Journal of Yangzhou University(Agricultural and Life Science Edition), 2022, 43(1): 56-61. DOI: 10.16872/j.cnki.1671-4652.2022.01.008
Authors:GU Rong  TANG Xiujun  FAN Yanfeng  JIA Xiaoxu  GE Qinglian  LU Junxian  WANG Jue  GAO Yushi
Abstract:
Keywords:
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