| 西农关中奶山羊PDCD4基因的克隆与组织表达分析 |
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| 作者姓名： | 逄国梁 张海荣 王战航 朱俊儒 安小鹏 |
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| 作者单位： | 1. 陕西省畜牧技术推广总站;2. 西北农林科技大学动物科技学院 |
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| 基金项目： | 陕西省重点研发计划(2020ZDLNY02-01,2021NY-001,2021ZDLNY02-01,2021ZDLNY02-06); |
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| 摘 要： | 旨在研究程序性细胞死亡因子4(PDCD4)基因与奶山羊乳腺发育的关系。应用RT-PCR技术克隆PDCD4基因编码区(CDS)序列,并进行生物信息学分析,运用荧光定量PCR(qRT-PCR)技术检测不同组织mRNA相对表达量。结果表明：克隆获得的关中奶山羊PDCD4基因CDS序列长1 410 bp,编码469个氨基酸,分子质量为51.8 ku,分子式为C2245H3606N636O730S19,理论等电点为5.03;编码蛋白含有4个N-糖基化位点、6个O-糖基化位点及53个潜在的磷酸化位点;PDCD4蛋白为亲水性酸性蛋白质,无信号肽,无跨膜结构域;系统进化树显示PDCD4蛋白的氨基酸序列在不同物种间相似度较高,奶山羊与绵羊、牛、猫、猪、弯角大羚羊、美洲白尾鹿等同源性均在90%以上,其中与绵羊的亲缘关系最近;蛋白互作分析显示PDCD4蛋白能与EIF4A1、EIF4G1、PTEN、EIF4A2、EIF4B、RECK、GMPS、EEF1G等蛋白相互作用;qRT-PCR结果显示PDCD4...
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| 关 键 词： | 关中奶山羊 PDCD4 生物信息学 组织表达 |
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