| 5种海水养殖石首鱼类肠道菌群多样性的比较 |
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| 引用本文： | 林能锋,龚晖,许斌福,潘滢,曾红. 5种海水养殖石首鱼类肠道菌群多样性的比较[J]. 水产学报, 2022, 46(9): 1701-1712 |
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| 作者姓名： | 林能锋 龚晖 许斌福 潘滢 曾红 |
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| 作者单位： | 大黄鱼育种国家重点实验室；福建省农业科学院生物技术研究所,大黄鱼育种国家重点实验室；福建省农业科学院生物技术研究所,福建省农业科学院生物技术研究所,大黄鱼育种国家重点实验室,福建省农业科学院生物技术研究所,福建师范大学生命科学学院南方海洋研究院;福建师范大学生命科学学院南方海洋研究院 |
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| 基金项目： | 大黄鱼育种国家重点实验室开放基金(项目编号：LYC2017RS03)；福建师范大学生命科学学院2019年度“溪源江学者”扶持计划 |
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| 摘 要： | 为探究海水养殖石首鱼类肠道菌群的结构特征及宿主遗传因素对肠道菌群的影响，实验采用基于Illumina Hiseq2500测序平台的高通量测序技术，对福建宁德三都澳养殖的5种石首鱼类(大黄鱼、黄姑鱼、状黄姑鱼、和眼斑拟石首鱼)的肠道菌群进行16S rDNA V3～V4区测序分析。各样本得到unique tags的数目为20 351～43 347个，上述5种鱼类分别得到479、626、603、518和556个操作分类单元(OTUs)，分类注释结果显示，这些OTUs可划归33门273属。5种石首鱼类肠道内容物和肠道壁样品均以变形菌门、拟杆菌门和厚壁菌门细菌为主要优势菌群，约占总菌量的70%，在大黄鱼肠道菌群中，螺旋菌门细菌占比达26.19%，也是其主要优势菌群。在属分类水平上，芽孢杆菌属、发光杆菌属、弧菌属、金黄杆菌属、鞘氨醇单胞菌属及假单胞菌属等属细菌是5种养殖石首鱼类的主要类别。肠道菌群多样性的分析表明，Shannon多样性指数：黄姑鱼>状黄姑鱼>眼斑拟石首鱼>>大黄鱼，这些养殖石首鱼类的肠道内容物菌群的多样性均高于肠道壁。对上述鱼类种间的肠道菌群差异性分...
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| 关 键 词： | 石首鱼 肠道 菌群结构 16SrDNA |
| 收稿时间： | 2020-12-28 |
| 修稿时间： | 2021-07-22 |
Bacteriological analysis of the digestive tract of five species of mariculture Sciaenidae |
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| LIN Nengfeng,GONG Hui,XU Binfu,PAN Ying,ZENG Hong. Bacteriological analysis of the digestive tract of five species of mariculture Sciaenidae[J]. Journal of Fisheries of China, 2022, 46(9): 1701-1712 |
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| Authors: | LIN Nengfeng GONG Hui XU Binfu PAN Ying ZENG Hong |
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| Affiliation: | State Key Laboratory of Large Yellow Croaker Breeding, Ningde Fufa Fisheries Co., Ltd., Ningde 352100, China;Institute of Biotechnology, Fujian Academy of Agriculture Sciences, Fuzhou 350003, China; State Key Laboratory of Large Yellow Croaker Breeding, Ningde Fufa Fisheries Co., Ltd., Ningde 352100, China;Southern Institute of Oceanography, College of Life Sciences, Fujian Normal University, Fuzhou 350117, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | rearing croakers intestine microflora structure 16SrDNA |
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