基于网络药理学的灵芝作用机制研究 |
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作者姓名: | 徐靖 赵建霞 张国亮 王瑛 郑化先 李明焱 李振皓 |
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作者单位: | 1.浙江寿仙谷医药股份有限公司,浙江 武义 3212002.浙江寿仙谷植物药研究院有限公司,浙江 杭州 3100003.浙江省珍稀植物药工程技术研究中心,浙江 武义 3212004.寿仙谷珍稀药材产品省级重点农业企业研究院,浙江 武义 321200 |
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基金项目: | 浙江省重点研发计划(2017C02011,2019C02100); |
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摘 要: | 通过TCMSP数据库,结合化合物含量信息,从灵芝中筛选出类药性好且含量较高的化合物;通过TCMSP、TCMIP、Swiss Target Prediction、SuperPred等数据库,预测化合物相应靶点;采用STRING数据库,构建靶点蛋白质互作(PPI)网络,并筛选出核心靶点;通过Enrichr数据库,预测核心靶点对应疾病;通过Cytoscape的ClueGo模块,对核心靶点进行基因本体分析(GO)及通路富集分析(KEGG),最终建立化合物-靶点、化合物-靶点-疾病-通路网络。根据试验结果,共筛选出60种化合物的22个核心靶点;核心靶点对应的疾病集中在肿瘤、自身免疫性疾病等;GO分析发现,核心靶点参与了88个生物过程,主要分为8个类别;KEGG分析发现,核心靶点参与了5个代谢通路,分为4个类别;化合物-靶点-疾病-通路网络显示了化合物、靶点、疾病、通路间的相互作用,如Lucialdehyde C、Ganoderic aldehyde A可通过DRD2靶点及22个相关生物功能通路,对30种疾病发挥作用。
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关 键 词: | 灵芝 网络药理学 靶点 Cytoscape 作用机制 |
收稿时间: | 2021-10-17 |
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