| 基于16S rDNA序列的小贯小绿叶蝉共生细菌多样性研究 |
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| 引用本文： | 毛迎新,谭荣荣,王友平,陈 勋,王红娟,黄丹娟,龚自明.基于16S rDNA序列的小贯小绿叶蝉共生细菌多样性研究[J].植物保护,2018,44(3):17-23. |
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| 作者姓名： | 毛迎新 谭荣荣 王友平 陈 勋 王红娟 黄丹娟 龚自明 |
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| 作者单位： | 湖北省农业科学院果树茶叶研究所;湖北省农业科学院植保土肥研究所农业部华中作物有害生物综合治理重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划(2016YFD0200905); 湖北省农业科技创新中心团队项目(2016-620-000-001-032); 湖北省第二批现代农业产业技术体系项目 |
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| 摘 要： | 利用Illumina HiSeq技术,对赤壁、大悟、武汉、咸安和英山5个茶园小贯小绿叶蝉地理种群的成虫共生细菌16SrDNA-V4变异区进行测序,应用Uparse和RDP Classifier等软件统计和分析样本的物种组成、丰度和多样性。5个地区小贯小绿叶蝉成虫的16SrDNA基因序列文库共获得239 645条有效tags,在97%相似阈值下将其聚类为3 403个OTUs。共注释到41个门,116个纲,197个目,272个科,372个属,105个种。5个样本的共生菌在不同分类水平上的组成有所不同,其中在门水平上,主要优势菌为变形菌门Proteobacteria(相对丰度60.6%~97.1%);在纲水平上,相对丰度排名前5位中共有的优势菌为γ-变形菌纲Gammaproteobacteria和α-变形菌纲Alphaproteobacteria;在属水平上,排名前10位中5个样本共有的优势菌为盐单胞菌属Halomonas、希瓦氏菌属Shewanella和沃尔巴克氏体属Wolbachia。小贯小绿叶蝉成虫细菌的Chao指数、Ace指数、Shannon指数和Simpson指数分别为1 065.55~2 841.89,1 130.76~2 914.90,1.07~8.63和0.18~0.99。茶园小贯小绿叶蝉成虫共生细菌多样性比较丰富,不同地理种群的小贯小绿叶蝉细菌群落结构和多样性有差异。本研究结果为进一步研究细菌对小贯小绿叶蝉种群生物学的影响奠定了基础。
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| 关 键 词： | 小贯小绿叶蝉 细菌 16S rDNA 多样性 |
| 收稿时间： | 2017/9/6 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2017/10/24 0:00:00 |
Analysis of the bacterial diversity in adults of Empoasca (Matsumurasca) onukii based on 16S rDNA sequences |
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| MAO Yingxin,TAN Rongrong,WANG Youping,CHEN Xun,WANG Hongjuan,Huang Danjuan,GONG Ziming.Analysis of the bacterial diversity in adults of Empoasca (Matsumurasca) onukii based on 16S rDNA sequences[J].Plant Protection,2018,44(3):17-23. |
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| Authors: | MAO Yingxin TAN Rongrong WANG Youping CHEN Xun WANG Hongjuan Huang Danjuan GONG Ziming |
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| Institution: | 1. Institute of Fruits and Tea, Hubei Academy of Agricultural Sciences, Wuhan 430064, China; 2. Institute of Plant Protection, Soil and Fertilizers, Hubei Academy of Agricultural Sciences; Key Laboratory of Integrated Pest Management of Crop Pests in Central China, Ministry of Agriculture, Wuhan 430064, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Empoasca (Matsumurasca) onukii bacterium 16S rDNA diversity |
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