基于RNA-Seq鉴定黑羽番鸭肉质风味差异的候选基因

为挖掘黑羽番鸭肉质风味相关候选基因，通过对黑羽番鸭胸肌、腿肌中挥发性风味物质进行测定，并通过Illumina HiSeq2500高通量测序进行转录组对比分析，结合参考基因组对所获得的序列进行序列比对、基因注释和差异表达等分析，筛选出差异表达基因并进行GO富集分析。通过荧光定量PCR(Real-time PCR,qRT-PCR)方法检测4个差异候选基因表达水平，验证测序结果的可靠性。结果表明，黑羽番鸭胸肌中挥发性风味物质辛醛、2,3-辛二酮含量显著高于腿肌，3-羟基-2-丁酮含量显著低于腿肌(P<0.05)。通过参考基因组比对和差异表达分析，初步获得614个差异表达基因，171个差异基因在黑羽番鸭腿肌组织上调表达，443个差异基因在黑羽番鸭腿肌组织下调表达。结合GO分析和KEGG富集分析，最终获得了20个候选功能基因，它们分别参与机体氨基酸形成、糖代谢以及脂肪代谢等生物过程，其中10个差异候选基因在黑羽番鸭胸肌中参与肌内脂肪代谢过程，这些基因可能通过形成肌内挥发性风味物质进而影响肌肉风味。qRT-PCR验证结果表明，筛选出的差异候选基因表达趋势与转录组测序中表达的趋势相似，说明测序...