| 水稻芽期响应镉胁迫的转录组分析 |
| |
| 作者姓名： | 王燕宁 黄涛 吴光亮 黄诗颖 钟奇 王鹏 杨朦朦 李才敬 程琴 贺浩华 金伟 郭凌 边建民 |
| |
| 作者单位： | 作物生理生态与遗传育种教育部重点实验室,江西南昌 330045;作物生理生态与遗传育种教育部重点实验室,江西南昌 330045;江西省水稻高水平工程研究中心,江西南昌 330045;南昌市农业技术推广中心,江西南昌 330200 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(32160485)；;国家级大学生创新创业训练计划项目(202210410002)； |
| |
| 摘 要： | 为研究不同类型水稻对镉(Cd)胁迫差异的原因，以镉敏感籼稻恢复系昌恢891(CH891)和镉耐受粳稻品种02428为材料，选取种子萌发后，连续镉处理3 d的和未进行镉处理的幼芽，使用高通量Illumina HiSeq 4000测序技术进行RNA-Seq分析，共得到539 524 490个有效读长，与参考基因组的比对率在94.81%～96.82%,GC含量均在49%以上。通过比较分析，共检测到7 204个差异表达基因(DEGs),其中在CH891中特异表达的基因(SCR3)有849个，02428中特异表达的基因(RCR3)有676个，2个品种均有表达但表达量存在差异的基因(CCR3)有770个。KEGG和GO富集通路分析表明，异黄酮生物合成、磷酸肌醇代谢、黄酮类生物合成和花青素生物合成途径在SCR3中显著富集，细胞核、自噬调节和胰岛素抗性途径在RCR3中显著富集，α-亚麻酸代谢、吞噬体、柠檬烯和蒎烯降解和脂肪酸降解途径在CCR3中显著富集。结果表明，Cd处理后，次级代谢过程主要在CH891中富集，蛋白质代谢主要在02428中富集，综上所述，CH891和02428响应的代谢路径存在差异，控...
|
| 关 键 词： | 籼稻 粳稻 镉胁迫 转录组 差异表达 |
| 本文献已被 万方数据 等数据库收录！ |
|
