辣椒CAMTA基因家族生物信息学分析

为了解辣椒中CAMTA基因家族生物信息学功能，探究其在非生物胁迫下的基因表达规律，进而为辣椒CAMTA基因的功能开发与抗逆育种提供基础，在Plant TFDB网站得到辣椒CAMTA家族成员，并对其基因结构、结构域、蛋白质三级结构、系统进化关系、顺式作用元件、激素处理与非生物胁迫表达情况进行分析。结果表明，在辣椒中有5个CAMTA家族成员，均包含CG-1保守结构域；主要分布在4条染色体上，其基因大小差异明显，氨基酸数目在89～1 023个之间，外显子数目为1～13个。进化树分析表明，辣椒CAMTA基因家族可以分为3类，辣椒CAMTA的氨基酸序列与番茄CAMTA的氨基酸序列亲缘关系最近。基因表达量分析表明，辣椒CAMTA基因家族在胁迫后的信号转导和组织发育过程中发挥了作用。