首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
     

基于BSA-seq技术挖掘糙皮侧耳抗螨候选基因
作者姓名:李辉平  骆昕  侯子强  蒋宁  林金盛  侯立娟  徐平  马林  曲绍轩
作者单位:江苏省农业科学院蔬菜研究所,江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室,江苏 南京 210014;江苏大学生命科学学院,江苏 镇江 212013;江苏省农业科学院蔬菜研究所,江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室,江苏 南京 210014;江苏大学生命科学学院,江苏 镇江 212013
基金项目:国家自然科学青年基金项目(32001911);;财政部和农业农村部国家现代农业产业技术体系资助项目(CARS-20);
摘    要:根据前期不同糙皮侧耳菌株抗螨性差异调查结果,构建了糙皮侧耳孢子单核体群体,群体内479个菌株抗螨性呈正态分布。利用BSA-seq技术对高抗和高感混池进行SNP和InDel位点的欧氏距离关联分析,将抗螨性候选基因定位到一条染色体上,2个相邻候选区域总长度为1.75 Mb,内有基因605个,其中非同义突变基因353个,移码突变基因89个。经功能注释以及GO和KEGG通路富集等分析,发现26个候选基因参与了信号传导、防御过程和次级代谢相关通路,推测这些候选基因可能与糙皮侧耳抗螨性相关。

关 键 词:糙皮侧耳(平菇)  抗螨候选基因  群体分离分析法
本文献已被 万方数据 等数据库收录!
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号