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荞麦3个种子蛋白基因的序列和表达分析
引用本文:黄娟,邓娇,石桃雄,梁成刚,张启迪,陈庆富.荞麦3个种子蛋白基因的序列和表达分析[J].华南农业大学学报,2017,38(1):23-30.
作者姓名:黄娟  邓娇  石桃雄  梁成刚  张启迪  陈庆富
作者单位:贵州师范大学 荞麦产业技术研究中心,贵州 贵阳,550001
基金项目:国家自然科学基金(31471562,31171609);国家现代农业产业技术体系专项资金 (CARS-08-A4);贵州省荞麦工程技术研究中心项目(黔科合农G字【2015】4003号);贵州师范大学博士基金资助项目(11904/0516031, 11904/0516026)
摘    要:【目的】阐明荞麦Fagopyrum中3个种子蛋白基因序列的特征及其在种子发育过程中的作用,为探讨荞麦种子发育过程分子机制提供理论依据。【方法】利用本地Perl程序、BLASTP、MEGA6、PLANTCARE等,分析了荞麦3个种子蛋白基因(13S球蛋白基因、11S球蛋白基因和谷蛋白基因)序列及其编码蛋白质的进化关系,预测启动子区域的顺式作用元件。通过荧光定量PCR技术分析3个基因在甜荞F.esculentum、苦荞F.tataricum和金荞F.cymosum种子发育过程中的表达情况。【结果】13S球蛋白基因含有4个外显子和3个内含子,蛋白序列长515 aa,与苦荞中的一个13S球蛋白(Gene Bank登录号:ABI32184.1)仅有6个氨基酸不同,推测二者为同一个基因,在苦荞灌浆中期表达量最高;11S球蛋白基因含有8个外显子和7个内含子,蛋白序列长914 aa,与欧洲慈姑中的一个11S球蛋白(Gene Bank登录号:ABB77213.1)亲缘关系最近,在苦荞灌浆中期表达量最高;谷蛋白基因含有3个外显子和2个内含子,蛋白序列长355 aa,与甜菜中的一个B5型谷蛋白(Gene Bank登录号:XP_010683769.1)亲缘关系最近,在甜荞灌浆中期表达量最高。3个基因的启动子区域均含有大量响应逆境和激素的顺式作用元件,以及在胚乳中表达所需的顺式作用元件。【结论】本研究获得了1个13S球蛋白基因序列、1个11S球蛋白基因序列和1个谷蛋白基因序列,这3个基因可能在胚乳中优势表达,并且参与到逆境胁迫和激素响应的过程中;灌浆中期是种子蛋白积累的关键时期,3个基因均在这一时期大量表达,这为后续进一步研究基因功能奠定了基础。

关 键 词:荞麦  种子蛋白  灌浆期  基因表达
收稿时间:2016/3/6 0:00:00

Sequence and expression analyses of three seed protein genes of buckwheat
HUANG Juan,DENG Jiao,SHI Taoxiong,LIANG Chenggang,ZHANG Qidi and CHEN Qingfu.Sequence and expression analyses of three seed protein genes of buckwheat[J].Journal of South China Agricultural University,2017,38(1):23-30.
Authors:HUANG Juan  DENG Jiao  SHI Taoxiong  LIANG Chenggang  ZHANG Qidi and CHEN Qingfu
Abstract:
Keywords:buckwheat  seed protein  filling stage  gene expression
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