| 荣昌猪、长白猪先天免疫候选基因筛选 |
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| 引用本文： | 龙熙,赵久刚,柴捷,潘红梅,张亮,张廷焕.荣昌猪、长白猪先天免疫候选基因筛选[J].华北农学报,2021,36(z1):373-380. |
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| 作者姓名： | 龙熙 赵久刚 柴捷 潘红梅 张亮 张廷焕 |
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| 作者单位： | 重庆市畜牧科学院,重庆 402460 |
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| 基金项目： | 现代农业产业技术体系;重庆市绩效激励引导专项;国家自然科学基金 |
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| 摘 要： | 旨在探究影响荣昌猪和长白猪机体先天免疫功能的候选基因.以新生荣昌猪、长白猪胸腺为研究对象,利用RNA-seq分析荣昌猪、长白猪胸腺组织中的差异表达基因,同时对差异表达基因进行GO和KEGG富集分析,并通过qRT-PCR验证RNA-seq结果的准确性.结果表明:在新生荣昌猪和长白猪胸腺中,差异倍数在2倍以上的基因共421个,其中,荣昌猪相对长白猪上调的有231个,下调的有190个.GO富集分析发现,这些差异表达基因主要富集在清道夫受体活性、G蛋白偶联受体结合、T细胞活化、细胞分泌调节、胞吐作用调节、SNARE复合物组装调节等生物学过程.KEGG通路分析发现,这些差异表达基因主要参与细胞因子-细胞因子受体互作、cAMP信号、代谢(磷脂酶D、半胱氨酸和蛋氨酸)及一些疾病(非洲锥形病、癌症)相关信号通路.6个差异表达基因的RT-qPCR结果表明,此次RNA-seq的结果准确可靠.综合差异表达基因、GO和KEGG信号通路结果发现,TMSB15A和STAB2、SAA1和HP分别是荣昌猪和长白猪胸腺先天免疫的候选基因.
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| 关 键 词： | 猪 先天免疫 RNA-seq 候选基因 抗病 |
Screening of Innate Immune Candidate Genes in Rongchang Pigs and Landrace |
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| LONG Xi,ZHAO Jiugang,CHAI Jie,PAN Hongmei,ZHANG Liang,ZHANG Tinghuan.Screening of Innate Immune Candidate Genes in Rongchang Pigs and Landrace[J].Acta Agriculturae Boreali-Sinica,2021,36(z1):373-380. |
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| Authors: | LONG Xi ZHAO Jiugang CHAI Jie PAN Hongmei ZHANG Liang ZHANG Tinghuan |
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