| 滇重楼叶绿体基因组特征及密码子偏好性分析 |
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| 引用本文： | 王宇飞,江媛,杨成金,王婧,徐志超,段宝忠.滇重楼叶绿体基因组特征及密码子偏好性分析[J].分子植物育种,2021,19(22):7448-7458. |
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| 作者姓名： | 王宇飞 江媛 杨成金 王婧 徐志超 段宝忠 |
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| 作者单位： | 大理大学药学院,大理,671000;云南白药集团中药资源有限公司,昆明,650500;大理大学药学院,大理,671000;东北林业大学生命科学院,哈尔滨,150040;东北林业大学生命科学院,哈尔滨,150040 |
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| 摘 要： | 为探究滇重楼叶绿体基因组功能、结构及密码子使用偏好性,本研究对滇重楼叶绿体基因组进行测序、组装,并对其结构、基因功能、密码子偏好性、影响因素、最优密码子进行分析.结果 显示,滇重楼叶绿体基因组具有典型的四分体结构,全长164130bp,平均GC含量为37.00％,LSC、IRs和SSC长度分别为84363、33433和12901 bp;注释得到133个功能基因,其中包括87个蛋白质编码基因,8个核糖体rRNA基因和38个tRNA基因.密码子偏好性分析结果显示,滇重楼叶绿体基因组密码子使用模式主要受到自然选择因素的影响,最优密码子多以A或U碱基结尾.本研究为进一步探讨滇重楼异源表达及基因功能提供了一定参考,也为在分子水平上研究重楼属植物的系统进化提供了相应的理论基础.
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| 关 键 词： | 滇重楼 叶绿体基因组 密码子偏好性 最优密码子 |
Analysis of Chloroplast Genome Characteristic and Codon Usage Bias in Paris polyphylla var.yunnanensis |
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| Wang Yufei,Jiang Yuan,Yang Chengjin,Wang Jing,Xu Zhichao,Duan Baozhong.Analysis of Chloroplast Genome Characteristic and Codon Usage Bias in Paris polyphylla var.yunnanensis[J].Molecular Plant Breeding,2021,19(22):7448-7458. |
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| Authors: | Wang Yufei Jiang Yuan Yang Chengjin Wang Jing Xu Zhichao Duan Baozhong |
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