| 中华鲟GH蛋白二级结构和B细胞抗原表位的预测 |
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| 引用本文： | 刘红艳,杨东,张繁荣,余来宁. 中华鲟GH蛋白二级结构和B细胞抗原表位的预测[J]. 安徽农业科学, 2009, 37(10): 4527-4529 |
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| 作者姓名： | 刘红艳 杨东 张繁荣 余来宁 |
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| 作者单位： | 江汉大学生命科学学院,湖北武汉,430056;江汉大学生命科学学院,湖北武汉,430056;江汉大学生命科学学院,湖北武汉,430056;江汉大学生命科学学院,湖北武汉,430056 |
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| 摘 要： | [目的]对中华鲟GH蛋白的二级结构及B细胞表位进行分析和预测。[方法]以中华鲟GH蛋白的氨基酸序列为基础,采用Garnier-Robson法、Chou-Fasman法和Karplus-Schulz法预测中华鲟GH蛋白二级结构;按Kyte-Doolittle法、Emini法和Jameson-Wolf法预测中华鲟GH蛋白的细胞表位。[结果]GH蛋白N端第37～51、88～92、97～104、133～148和187～193区段可能为α螺旋中心,在GH蛋白N端第6～17、24～35、56～57、105～107、109～110、117～119、124～126和204～208区段可能为β折叠中心,在GH蛋白分子N端第18～23、55～56、67～73、83～86、112～114、151～157和209～211区段具有较柔软的结构,这些区段有可能进行一定幅度的摆动或折叠而形成较复杂的三级结构。GH蛋白N端第19～23、51～71、84～95、128～139、164～176、189～196区段可能是B细胞的表位,在GH蛋白分子的这些区域内或附近都有柔性区域。因此这几个区段内或附近很可能是B细胞表位的优势区域。[结论]该研究结果对中华鲟GH蛋白单克隆抗体的制备,以及中华鲟分子调控机理的探讨具有一定的参考意义。
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| 关 键 词： | 中华鲟 GH蛋白 二级结构 细胞表位 |
Prediction of Secondary Structure and B Cell Epitope of GH Protein from Acipenser sinensis |
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| LIU Hong-yan et al. Prediction of Secondary Structure and B Cell Epitope of GH Protein from Acipenser sinensis[J]. Journal of Anhui Agricultural Sciences, 2009, 37(10): 4527-4529 |
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| Authors: | LIU Hong-yan et al |
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| Affiliation: | LIU Hong-yan et al(College of Life Science,Jianghan University,Wuhan,Hubei 430056) |
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| Abstract: | [Objective] The aim was to predict the secondary structure and B cell epitope of growth hormone(GH) protein from Acipenser sinensis.[Method] With the amino acid sequence of GH protein from A.sinensis as the base,the secondary structure of GH protein from A.sinensis was predicted by the method of Garnier-Robson,Chou-Fasman and Karplus-Schulz,and its cell epitope was predicted by the method of Kyte-Doolittle,Emini and Jameson-Wolf.[Result] The sections of 18-23,55-56,67-73,83-86,112-114,151-157 and 209-211 in... |
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| Keywords: | Acipenser sinensis GH protein Secondary structure Cell epitope |
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