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基于55K SNP芯片分析的优质小麦的遗传多样性
引用本文:张 楠,彭义峰,李亚青,张士昌,李孟军,何明琦. 基于55K SNP芯片分析的优质小麦的遗传多样性[J]. 麦类作物学报, 2022, 42(3): 264-271. DOI: 10.7606/j.issn.1009-1041.2022.03.02
作者姓名:张 楠  彭义峰  李亚青  张士昌  李孟军  何明琦
作者单位:石家庄市农林科学研究院,河北省小麦工程技术研究中心,河北石家庄050041
基金项目:国家现代农业小麦产业技术体系项目 (CARS-03);河北省重点研发计划项目(20326346D)
摘    要:为分析优质小麦品种的遗传多样性,探讨其亲缘关系,以45个优质小麦品种和5个优质高代品系为试验材料,利用55K SNP芯片对其杂合度、遗传相似度、群体遗传结构和染色体低多态性区段进行分析。结果表明,45个优质小麦品种的遗传相似度系数(GS)为0.488~0.928,平均值为0.603,其中16个品种与其他品种的GS均高于0.800;50个优质小麦品种(系)可分为2个类群7个亚群,其中类群1可分为6个亚群。除亚群Ⅴ的10个品种外,其余亚群品种的遗传聚类结果与品种系谱来源较为吻合。B基因组的多态性SNP位点最多,A基因组次之,D基因组最少。在21条染色体中,4D染色体上的多态性SNP位点最少。A基因组和D基因组染色体低多态性区段高于B基因组。在优质小麦选育过程中,A基因组和D基因组受到的选择压力高于B基因组。

关 键 词:优质小麦  SNP芯片  遗传多样性  遗传相似度系数  进化树分析

Genetic Diversity Analysis of High-Quality Wheat Cultivars Based on 55K SNP Arrays
ZHANG Nan,PENG Yifeng,LI Yaqing,ZHANG Shichang,LI Mengjun,HE Mingqi. Genetic Diversity Analysis of High-Quality Wheat Cultivars Based on 55K SNP Arrays[J]. Journal of Triticeae Crops, 2022, 42(3): 264-271. DOI: 10.7606/j.issn.1009-1041.2022.03.02
Authors:ZHANG Nan  PENG Yifeng  LI Yaqing  ZHANG Shichang  LI Mengjun  HE Mingqi
Affiliation:(Shijiazhuang Academy of Agriculture and Forestry Sciences,Wheat Engineering Research Center of Hebei Province,Shijiazhuang,Hebei 050041,China)
Abstract:
Keywords:High-quality wheat   SNP array   Genetic diversity   Genetic similarity   NJ-tree analysis
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