| 小麦DEAD-box基因家族鉴定及其低温下的表达模式分析 |
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| 引用本文： | 齐 越,于 晶,苍 晶,田 宇,彭瞰看,王多佳,王政委,任治鹏,梁 伊,王晓楠,孟 婧. 小麦DEAD-box基因家族鉴定及其低温下的表达模式分析[J]. 麦类作物学报, 2022, 0(2): 127-138 |
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| 作者姓名： | 齐 越 于 晶 苍 晶 田 宇 彭瞰看 王多佳 王政委 任治鹏 梁 伊 王晓楠 孟 婧 |
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| 作者单位： | （1.东北农业大学生命科学学院，黑龙江哈尔滨 150030； 2.东北农业大学农学院，黑龙江哈尔滨 150030） |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（31971831） |
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| 摘 要： | DEAD-box RNA解旋酶是RNA代谢途径中的关键酶，在RNA代谢过程中调控植株的生长发育和抗逆性。目前，尚未见有人对小麦DEAD-box基因家族进行系统鉴定与分析。为探究小麦DEAD-box基因的功能，本研究以水稻DEAD-box基因家族基因为参照，从小麦全基因组数据库中共鉴定到134个小麦DEAD-box家族基因，并利用生物信息学对其家族成员的理化性质、基因结构、进化树和共线性进行分析。结果表明，小麦DEAD-box蛋白多数为弱碱性蛋白，亚细胞定位分布广泛，核分布最多；小麦与水稻DEAD-box家族基因亲缘性较高，小麦DEAD-box蛋白结构域与核心基序排列有序稳定，高度保守；小麦DEAD-box家族基因在进化过程中可能发生了节段性复制事件，水稻与小麦DEAD-box基因无序共线性连线，说明DEAD-box基因在进化过程中可能存在染色体异位突变。进一步以强抗寒冬小麦品种东农冬麦1号(Dn1)和东农冬麦2号(Dn2)为材料，对其转录组库中低温差异表达的7个DEAD-box基因进行qRT-PCR分析，结果表明，这7个基因在不同品种和不同组织中表达量均有差异。Dn1中DEAD-box基因的表达量在 -10 ℃达到峰值，而Dn2中DEAD-box基因的表达量在-25 ℃达到峰值。
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| 关 键 词： | 小麦；DEAD-box；生物信息学；qRT-PCR；低温胁迫 |
Identification of DEAD-box Gene Family and Expression Analysis in Response to Cold Stress in Wheat |
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| QI Yue,YU Jing,CANG Jing,TIAN Yu,PENG Kankan,WANG Duoji,WANG Zhengwei,REN Zhipeng,LIANG Yi,WANG Xiaonan,MENG Jing. Identification of DEAD-box Gene Family and Expression Analysis in Response to Cold Stress in Wheat[J]. Journal of Triticeae Crops, 2022, 0(2): 127-138 |
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| Authors: | QI Yue YU Jing CANG Jing TIAN Yu PENG Kankan WANG Duoji WANG Zhengwei REN Zhipeng LIANG Yi WANG Xiaonan MENG Jing |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Wheat DEAD-box Bioinformatics analysis qRT-PCR Cold Stress |
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