| 西瓜嗜酸菌pilL菌毛基因的序列分析 |
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| 引用本文： | 林振亚,高必达,赵廷昌. 西瓜嗜酸菌pilL菌毛基因的序列分析[J]. 北方园艺, 2013, 0(13) |
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| 作者姓名： | 林振亚 高必达 赵廷昌 |
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| 作者单位： | 1. 湖南农业大学生物安全科学技术学院,湖南长沙,410128
2. 中国农业科学院植物保护研究所,植物病虫害生物学国家重点实验室,北京100193 |
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| 基金项目： | 国家西甜瓜产业技术体系专项资助项目，国家公益性行业(农业)科研专项资助项目 |
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| 摘 要： | 在西瓜嗜酸菌标准菌株AAC00-1全基因组序列中选取了1个菌毛基因pilL序列,利用这个基因设计引物,选取国内外比较有代表性的7株西瓜嗜酸菌菌株进行PCR扩增,并对PCR产物进行了测序,从生物信息学的角度对这7个菌株pilL基因的序列特征、同源性、分子聚类、信号肽、疏水性、跨膜结构和二级蛋白结构进行了预测分析.结果表明:Aac5、pslbtw37、W1和pslbtw22 pilL基因之间的核苷酸氨基酸特征相近,同源性高,AAC00-1、AAC203-50和Fc376之间亦如此.预测发现7个编码蛋白表现为亲水性,都无跨膜结构,Aac5、pslbtw37和W1 pilL基因都存在一个类型为SPI的信号肽,其分泌蛋白所到达的亚细胞位点为s(即分泌到周质空间).
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| 关 键 词： | 西瓜嗜酸菌 pilL基因 生物信息学分析 |
Sequence Analysis of pilL Gene of Acidovorax citrull |
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