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青海省小麦品种基于55K SNP芯片的遗传多样性分析
引用本文:谢静敏,侯万伟,张小娟. 青海省小麦品种基于55K SNP芯片的遗传多样性分析[J]. 麦类作物学报, 2022, 0(11): 1343-1350
作者姓名:谢静敏  侯万伟  张小娟
作者单位:(1. 青海大学生态环境工程学院,青海西宁 810016; 2. 青海省农林科学院, 青海西宁 810016)
基金项目:国家自然科学基金项目(32060612)
摘    要:
为研究青海省小麦品种之间的遗传关系和遗传多样性,选取93个青海小麦品种,基于55K SNP芯片对其进行全基因组扫描,并进行遗传多样性分析。结果共扫描到53 063个SNP位点,选择分型成功率(call rate, CR)≥0.90、缺失率<10%、MAF>0.05的SNP位点,获得多态性SNP位点50 243个,多态性比率为94.68%。其中多态性位点在第2同源群中分布最多,在第4同源群中分布最少,在基因组中分布呈现B>A>D,特别是4D染色体上的多态性SNP分布最少。93个小麦品种的多态性信息含量(PIC)为0.00~0.59,平均值为0.33,为中度多态性位点;两两品种间的遗传距离为0.00~0.67,平均值为0.41。通过聚类分析表明,根据遗传距离可将93个小麦品种划分为8个类群。综上,青海省现有小麦品种的遗传关系较近,需要引进外来品种来丰富青海省小麦品种的遗传多样性,推动小麦品种的选育及研究工作。

关 键 词:青海省  小麦  55K SNP  遗传多样性

Genetic Diversity Analysis of Wheat in Qinghai Province Based on 55K SNP Array
XIE Jingmin,HOU Wanwei,ZHANG Xiaojuan. Genetic Diversity Analysis of Wheat in Qinghai Province Based on 55K SNP Array[J]. Journal of Triticeae Crops, 2022, 0(11): 1343-1350
Authors:XIE Jingmin  HOU Wanwei  ZHANG Xiaojuan
Affiliation:(1.College of Eco-Environmental Engineering,Qinghai University,Xining,Qinghai 810016,China;2.Qinghai Academy of Agriculture and Forestry Sciences, Xining,Qinghai 810016,China)
Abstract:
Keywords:Qinghai Province   Wheat   55K SNP   Genetic diversity
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