| 铁皮石斛RRT家族全基因组鉴定及表达分析 |
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| 引用本文： | 聂 聪,龙小琴,何基泽,孙语钒,赵欣宇,王万军,朱乾坤.铁皮石斛RRT家族全基因组鉴定及表达分析[J].西北农业学报,2022(12):1605-1614. |
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| 作者姓名： | 聂 聪 龙小琴 何基泽 孙语钒 赵欣宇 王万军 朱乾坤 |
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| 作者单位： | (西南交通大学 生命科学与工程学院，成都 610031) |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31900164);中央高校基本科研业务费(2682021CX121);四川省大学生创新创业训练计划(2021169);西南交大个性化实验项目(GX2021160043)。 |
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| 摘 要： | 多糖是药用植物铁皮石斛(Dendrobium officinale)的主要成分之一。鼠李半乳糖醛酸聚糖Ⅰ鼠李糖转移酶(rhamnogalacturonⅠrhamnosyltransferase, RRT)在Ⅰ型鼠李半乳糖醛酸聚糖的合成中起重要作用。利用生物信息学在全基因组水平鉴定出4个铁皮石斛RRT家族基因( DoRRT1、 DoRRT2、 DoRRT3、 DoRRT4),通过逆转录定量PCR检测该基因家族在不同组织和胁迫下的表达情况。结果表明：在系统发育上DoRRT1、DoRRT3被聚为一组，DoRRT2、DoRRT4被聚为一组；DoRRT蛋白均为亲水蛋白质，可定位于高尔基体；DoRRT蛋白的α-螺旋和无规卷曲较多；4个DoRRT蛋白均有O-FucT保守结构域；组织表达显示 DoRRT1、 DoRRT2、 DoRRT4在根、茎、叶中均有表达，且在地上部的转录水平较高；胁迫表达表明 DoRRT2、 DoRRT4在高温胁迫下表达显著下调， DoRRT2在PEG模拟干旱条件下表达显著下调，说明 DoRRT2、 DoRRT4参与非生物胁迫响应。以上结果为深入研究DoRRT的生物学功能提供数据...
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| 关 键 词： | 铁皮石斛 鼠李半乳糖醛酸聚糖Ⅰ鼠李糖转移酶RRT 生物信息学分析 表达分析 |
Genome-wide Identification and Expression Analysis of RRT Family from Dendrobium officinale |
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| NIE Cong,LONG Xiaoqin,HE Jize,SUN Yufan,ZHAO Xinyu,WANG Wanjun and ZHU Qiankun.Genome-wide Identification and Expression Analysis of RRT Family from Dendrobium officinale[J].Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica,2022(12):1605-1614. |
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| Authors: | NIE Cong LONG Xiaoqin HE Jize SUN Yufan ZHAO Xinyu WANG Wanjun and ZHU Qiankun |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Dendrobium officinale RRT Bioinformatics analysis Expression analysis |
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