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椰子SSR反应体系的建立和优化
引用本文:柳晓磊,汤华,李东栋,王茜,周蓉,林艳青.椰子SSR反应体系的建立和优化[J].华中农业大学学报,2007,26(5):676-679.
作者姓名:柳晓磊  汤华  李东栋  王茜  周蓉  林艳青
作者单位:1. 海南大学生命科学与农学院,海口,570228
2. 海南大学理工学院,海口,570228
基金项目:国家自然科学基金项目(30560092),海南省自然科学基金项目(80406),海南省教育厅高校科研项目(Hjkj200510)资助
摘    要:为摸索适宜椰子的SSR反应体系,分析了PCR反应体系中的Mg2 浓度、引物浓度、dNTP浓度、TaqDNA聚合酶浓度、模板浓度以及退火温度对扩增结果的影响,建立了适合椰子的SSR反应体系。研究结果表明:在20μL反应体系中,Mg2 、引物和dNTP的最适浓度分别为2.5 mmol/L、0.3μmol/L、0.2 mmol/L;TaqDNA聚合酶的最佳使用量为1 U,模板DNA应加入50 ng,引物最佳退火温度比Tm值较小者低2~3℃。在参数优化的基础上,应用标记分析该反应体系对24个海南不同地区高种椰子样品进行SSR分析,不同样品间DNA谱带多态性丰富,本研究建立的分析体系将为今后椰子资源的SSR分析奠定良好的研究基础。

关 键 词:椰子(Cocosnucifera  L.)  SSR反应体系  优化
文章编号:1000-2421(2007)05-0676-04
修稿时间:2007-04-05

Optimization and Establishment of SSR Analysis Method in Coconut (Cocos nucifera L. )
LIU Xiao-lei,TANG Hu,LI Dong-dong,WANG Qian,ZHOU Rong,LIN Yan-qing.Optimization and Establishment of SSR Analysis Method in Coconut (Cocos nucifera L. )[J].Journal of Huazhong Agricultural University,2007,26(5):676-679.
Authors:LIU Xiao-lei  TANG Hu  LI Dong-dong  WANG Qian  ZHOU Rong  LIN Yan-qing
Institution:1.College of Life Science and Agriculture, Hainan University, Haikou 570228, China; 2. College of Science and Technology, Ha inan University, Haikou 570228, China
Abstract:
Keywords:coconut(Cocos nucifera L  )  SSR analysis  optimization
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