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| 牙鲆变态早期cDNA文库的构建和parvalbumin基因的克隆 | |
| 引用本文： | 龚小玲.牙鲆变态早期cDNA文库的构建和parvalbumin基因的克隆[J].水产学报,2005,29(4):467-472. |
| 作者姓名： | 龚小玲 |
| 作者单位： | 1. 上海水产大学生命科学与技术学院,上海,200090 2. 上海水产大学生命科学与技术学院,上海,200090;复旦大学遗传学国家重点实验室,上海,200433 3. 复旦大学遗传学国家重点实验室,上海,200433 |
| 基金项目： | 上海市教委发展基金项目（科2000-104）;上海水产大学校长基金项目（2004-43）;上海市教委重点学科项目 |
| 摘 要： | 在前期的研究中,克隆到牙鲆变态早期和变态前差异表达的parvalbumin基因片断cDNA。为了克隆parvalbumin基因的全长cDNA,构建了变态早期(孵化后23d仔鱼)牙鲆头部的全长cDNA文库,并对文库的滴度和插入片段大小进行了评估。同时采用锚定PCR法从cDNA文库筛选出parvalbumin基因的全长cDNA。结果表明,所构建的牙鲆变态早期头部cDNA文库的滴度为1.2×106PFU·mL-1,插入片段的平均长度为1000bp左右。parvalbumin基因的全长cDNA的长度为603bp,编码109个氨基酸,含有两个EF手型钙离子结合域:DQDGSGFIEEEEL(52～64)和DSDGDGKIGVEEF(91～103),以及一个ATP/GTP结合位点模序:ACGLAGKS(33～40),是一种典型的钙离子结合蛋白。通过parvalbumin基因氨基酸序列的同源比较分析表明,牙鲆parvalbumin基因是比较保守的蛋白,与其它鱼类享有61.5%～68.8%序列同源。系统分析表明,牙鲆的parvalbumin基因与狭鳕(Theragrachalcogramma)最为接近。 |
| 关 键 词： | 牙鲆 变态早期 全长cDNA文库 锚定PCR parvalbumin基因 钙离子结合蛋白 |
| 文章编号： | 1000-0615（2005）04-0467-06 |
| 收稿时间： | 2005-03-16 |
| 修稿时间： | 2005年3月16日 |
Construction of cDNA library and analysis of parvalbumin gene sequence in metamorphosing flounder Paralichthys olivaceus |
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| GONG Xiao-ling.Construction of cDNA library and analysis of parvalbumin gene sequence in metamorphosing flounder Paralichthys olivaceus[J].Journal of Fisheries of China,2005,29(4):467-472. | |
| Authors: | GONG Xiao-ling |
| Institution: | GONG Xiao-ling~1,BAO Bao-long~ 1,2,YANG Gui-mei~1,REN Da-ming~2 |
| Abstract: | |
| Keywords: | Paralichthys oliraceus metamorphosis full-length cDNA library anchor-PCR parvalbumin gene calcium-binding protein |
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