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| 广西合浦珠母贝3个不同群体遗传关系分析 | |
| 作者姓名： | 邹杰 彭慧婧 郑德斌 张守都 |
| 作者单位： | 1. 广西科学院;2. 广西海洋研究所有限责任公司;3. 天津渤海水产研究所;4. 山东省海洋科学研究院 |
| 基金项目： | 广西重点研发项目(桂科AB18294001); |
| 摘 要： | 为探索广西合浦珠母贝群体内杂交组合方式,分别从北海野生群体(F1)、选育群体(F4)和养殖群体中随机挑选2龄种贝样本15个,进行简化基因组测序,通过单核苷酸多态标记解析3个群体的遗传关系。研究结果显示,获得超过585 000个单核苷酸多态标记,野生群体、选育群体和养殖群体的观测杂合度分别为0.1975、0.1679和0.1783,期望杂合度分别为0.2545、0.2469和0.2732,平均近交系数分别为0.2075、0.3449和0.3465,多态信息含量分别为0.2032、0.2089和0.2241,选育群体近交系数与养殖群体相近,野生群体和养殖群体的群体遗传多态高于选育群体。系统进化树和主成分分析显示,选育群体与养殖群体部分样品亲缘关系较近。选育群体和养殖群体之间的遗传分化指数最低,部分亲本同源的可能性较大;野生群体、选育群体和养殖群体的平均长纯合片段数分别为59.1、49.5个和56.6个,长纯合片段平均长度分别为0.312、0.313 Mb和0.311 Mb,平均单核苷酸多态标记含量分别为59、50和73,近交系数FROH... |
| 关 键 词： | 合浦珠母贝 杂交 单核苷酸多态 遗传分化 长纯合片段 |