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沙冬青CBF/DREB1转录因子cDNA的克隆及序列分析
引用本文:杨杞,白肖飞,高阳,伊莉佳,丛靖宇,王瑞刚,李国婧.沙冬青CBF/DREB1转录因子cDNA的克隆及序列分析[J].广西农业生物科学,2009(6):1043-1048.
作者姓名:杨杞  白肖飞  高阳  伊莉佳  丛靖宇  王瑞刚  李国婧
作者单位:内蒙古农业大学生物工程学院
基金项目:国家高技术研究发展计划(2006AA100109);教育部春晖计划(Z2007-1-01013);教育部新世纪优秀人才支持计划(NCET-08-0871);内蒙古自治区人才开发基金;中国农业大学-内蒙古农业大学合作项目(2007)共同资助
摘    要:CBF/DREB1(C-repeat binding factor/dehydration resistance element binding protein 1)是一类抗逆相关的转录因子,它们的表达可以激活下游一系列抗逆应答基因的表达,从而提高植株的抗逆性。沙冬青(Ammopiptanthus mongolicus)主要生长在中国西北荒漠和半荒漠地带,是典型的旱生资源植物,具有突出的抗寒、抗旱、耐盐碱特性。本文以沙冬青为实验材料,利用RT-PCR和RACE技术克隆了沙冬青CBF/DREB1基因cDNA序列,并对其进行了序列分析。结果表明:沙冬青CBF/DREB1转录因子基因序列全长为991bp,包括624bp的开放阅读框(ORF),起始密码子ATG,终止密码子TAA,114bp的5’UTR和253bp的3’UTR,以及加尾信号AATAAA及poly(A)11。生物信息学预测其演绎的氨基酸序列具有AP2结构域,且AP2结构域的两端拥有CBF家族特有的PKK/RPAGRxKFxETRHP和DSAWR两段短多肽序列,属于CBF家族。沙冬青CBF/DREB1转录因子的克隆为进一步研究植物抗逆和获得抗性基因提供了新的候选基因,也为进一步从分子水平上验证其功能,深入理解植物适应干旱、低温和高盐机制奠定基础。

关 键 词:沙冬青  CBF/DREB1  RACE  序列分析
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