| 木薯中lncRNA-CRR5在低温胁迫下的功能分析 |
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| 引用本文： | 沈婕,董世满,李淑霞,彭明. 木薯中lncRNA-CRR5在低温胁迫下的功能分析[J]. 热带作物学报, 2021, 42(1): 40-46. DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2021.01.006 |
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| 作者姓名： | 沈婕 董世满 李淑霞 彭明 |
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| 作者单位： | 中国热带农业科学院热带生物技术研究所,海南海口 571101;海南大学热带作物学院,海南海口 570228;中国热带农业科学院热带生物技术研究所,海南海口 571101 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金青年基金项目(No.31701484);国家自然科学基金国际合作与交流项目(No.31561143012);国家重点研发计划项目(No.2018YFD1000500)。 |
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| 摘 要： | 低温胁迫严重影响木薯的生长、产量以及块根品质。长链非编码RNAs（lncRNAs）作为关键的调节因子,在植物响应非生物胁迫过程中发挥重要的功能。然而,lncRNAs在木薯中的功能和调控机制尚无报道。因此,为了研究木薯lncRNAs在低温胁迫应答中的功能,本研究以木薯主栽品种‘60444’为材料,利用低温处理前后的叶片转录组数据,鉴定到一个受低温胁迫调控的lncRNA（cold-responsive lncRNA5,CRR5）。通过对其序列比对进行同源性分析, RNA二级结构预测和共表达分析鉴定来分析lncRNA-CRR5响应低温胁迫的分子功能。并根据基因的共表达分析推测CRR5的顺式作用和反式作用靶基因。这些结果为更进一步研究CRR5的功能提供了理论依据。
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| 关 键 词： | 木薯 低温胁迫 lncRNA 功能分析 同源性分析 RNA二级结构预测 共表达基因分析 靶基因 |
| 收稿时间： | 2020-01-16 |
Identification of lncRNA-CRR5 in Response to Low TemperatureStress in Cassava |
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| SHEN Jie,DONG Shiman,LI Shuxia,PENG Ming. Identification of lncRNA-CRR5 in Response to Low TemperatureStress in Cassava[J]. Chinese Journal of Tropical Crops, 2021, 42(1): 40-46. DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2021.01.006 |
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| Authors: | SHEN Jie DONG Shiman LI Shuxia PENG Ming |
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| Affiliation: | 1. Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences, Haikou, Hainan 571101, China2. College of Tropical Crops, Hainan University, Haikou, Hainan 570228, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | cassava cold stress lncRNA functional analysis homology analysis RNA secondary structure co-expression gene analysis target genes |
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