| 蓖麻CNGC基因家族鉴定与冷胁迫下的表达模式分析 |
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| 引用本文： | 王晓宇,张洪雨,刘栩铭,孟迪,苑伟鹏,霍红雁,于丽丽,张继星. 蓖麻CNGC基因家族鉴定与冷胁迫下的表达模式分析[J]. 分子植物育种, 2021, 19(22): 7373-7382. DOI: 10.13271/j.mpb.019.007373 |
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| 作者姓名： | 王晓宇 张洪雨 刘栩铭 孟迪 苑伟鹏 霍红雁 于丽丽 张继星 |
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| 作者单位： | 内蒙古民族大学生命科学与食品学院,通辽,028000;内蒙古民族大学,科尔沁植物逆境生物学研究所,通辽,028000;内蒙古民族大学生命科学与食品学院,通辽,028000 |
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| 摘 要： | 环核苷酸门控通道蛋白(cyclic nucleotide-gated channel proteins,CNGCs)是介导低价阳离子转运的重要蛋白,在植物信号传递、生长发育与非生物胁迫响应等方面发挥重要作用.本研究利用序列比对法在蓖麻基因组水平进行CNGC家族成员鉴定;利用生物信息学手段对蓖麻CNGC家族成员的基因结构、保守基序、特征结构域、聚类方式、顺式作用元件及染色体定位信息进行分析.研究成功鉴定到17个蓖麻CNGC基因家族成员,定位于16个未完整拼接的染色体片段上;除RcCNGC13外,其他蛋白序列均包含高度保守的环核苷酸结合结构域CNBD,但RcCNGC4RcCNGC6RcCNGC13RcCNGC14均存在明显的基序缺失;部分RcCNGCs启动子区均含有MYB、MYC与ABRE、ARE元件,推测其响应逆境胁迫.聚类分析将蓖麻CNGC成员分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ组,推测不同类型CNGC蛋白存在功能差异.转录组数据分析发现仅有RcCNGC14受冷胁迫显著上调表达,暗示该基因参与调控蓖麻的冷适应性.本研究首次在蓖麻全基因组水平对CNGC基因家族进行鉴定,并分析其冷胁迫下的表达模式,为进一步创制蓖麻抗冷新种质提供重要的候选基因.
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| 关 键 词： | 蓖麻 CNGC基因家族 冷胁迫 表达模式 |
Identification of RcCNGC Gene Family in Castor Bean (Ricinus communis)and Analysis of Expression Pattern under Cold Stress |
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| Wang Xiaoyu,Zhang Hongyu,Liu Xuming,Meng Di,Yuan Weipeng,Huo Hongyan,Yu Lili,Zhang Jixing. Identification of RcCNGC Gene Family in Castor Bean (Ricinus communis)and Analysis of Expression Pattern under Cold Stress[J]. Molecular Plant Breeding, 2021, 19(22): 7373-7382. DOI: 10.13271/j.mpb.019.007373 |
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| Authors: | Wang Xiaoyu Zhang Hongyu Liu Xuming Meng Di Yuan Weipeng Huo Hongyan Yu Lili Zhang Jixing |
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