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高加索三叶草SSR序列特征分析
引用本文:刘佳雪,赵一航,胡尧,衣琨,刘皓玥,王丽娜,殷秀杰.高加索三叶草SSR序列特征分析[J].分子植物育种,2021,19(21):7154-7159.
作者姓名:刘佳雪  赵一航  胡尧  衣琨  刘皓玥  王丽娜  殷秀杰
作者单位:东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨,150030
摘    要:为获得高加索三叶草转录组特征,对高加索三叶草的根茎系统进行三代转录组测序,检测到79424条Unigene,序列总长为167351.88kb,进一步分析得到48235个SSR位点,平均3.47 kb出现一个SSR.高加索三叶草转录组的SSR类型丰富,其中单核苷酸和三核苷酸重复SSR数量最多,分别占SSR总数的45.8%和22.6%,其次是复杂SSR序列占比为15.2%、二核苷酸重复占比为12.8%、四核苷酸重复占比为2.1%、六核苷酸重复占比为0.9%和五核苷酸重复占比为0.6%.本研究对高加索三叶草转录组数据SSR位点信息进行分析,为三叶草属种质资源鉴定和分子标记辅助育种提供更多的标记资源.

关 键 词:高加索三叶草  转录组  SSR

Analysis of SSR Sequence Characteristics of Caucasus Clover
Liu Jiaxue,Zhao Yihang,Hu Yao,Yi Kun,Liu Haoyue,Wang Li'na,Yin Xiujie.Analysis of SSR Sequence Characteristics of Caucasus Clover[J].Molecular Plant Breeding,2021,19(21):7154-7159.
Authors:Liu Jiaxue  Zhao Yihang  Hu Yao  Yi Kun  Liu Haoyue  Wang Li'na  Yin Xiujie
Abstract:
Keywords:
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