中国水仙几丁质酶基因的克隆与表达分析 |
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引用本文: | 林晓红,潘鹤立,潘东明.中国水仙几丁质酶基因的克隆与表达分析[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2014,42(12):173-178. |
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作者姓名: | 林晓红 潘鹤立 潘东明 |
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作者单位: | 福建漳州城市职业学院;福建农林大学 园艺学院,园艺产品贮藏保鲜研究所,福建农林大学 园艺学院,园艺产品贮藏保鲜研究所,福建农林大学 园艺学院,园艺产品贮藏保鲜研究所 |
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基金项目: | 福建省林业厅创新项目“福建优势特色花卉水仙引种与产业化关键技术研究”(闽林种站(2013)42号) |
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摘 要: | 【目的】克隆中国水仙几丁质酶基因,分析其在水仙不同组织中的表达,为提高中国水仙的抗病性提供参考。【方法】利用RT-PCR技术克隆得到中国水仙几丁质酶基因,对其序列及编码氨基酸序列进行生物信息学分析,通过qRT-PCR分析该基因在感染基腐病、病毒病及褐斑病中国水仙根、叶中的表达。【结果】中国水仙几丁质酶基因的cDNA序列长768bp,编码230个氨基酸,其编码蛋白的分子质量为25.4ku,理论等电点为9.04,为不稳定蛋白,亲水性强,二级结构以α螺旋和无规则卷曲为主。该基因编码的蛋白与荷兰芹几丁质酶蛋白的亲缘关系最近,隶属于糖苷水解酶19家族,与溶菌酶相似超家族基因的保守结构域类似,推测其可能是兼具几丁质酶和溶菌酶的双功能酶。qRT-PCR分析表明,在水仙基腐病、病毒病及褐斑病发病过程中,水仙几丁质酶基因的表达量均显著提高。【结论】成功克隆得到中国水仙几丁质酶基因,推测该基因可能参与了水仙的抗病过程。
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关 键 词: | 中国水仙 几丁质酶基因 序列分析 抗病性 |
收稿时间: | 2014/5/13 0:00:00 |
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