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麦洼牦牛Toll样受体1基因的克隆及生物信息学分析
引用本文:陈亚冰,兰道亮,黄 偲,等.麦洼牦牛Toll样受体1基因的克隆及生物信息学分析[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2014,42(12):7-12.
作者姓名:陈亚冰  兰道亮  黄 偲  
作者单位:西南民族大学 生命科学与技术学院,西南民族大学 青藏高原研究院,西南民族大学 生命科学与技术学院
基金项目:西南民族大学研究生创新性项目(CX2014SZ75)
摘    要:【目的】克隆并分析高原牦牛Toll样受体1基因(TLR1)的特点。【方法】提取麦洼牦牛脾脏RNA,反转录合成cDNA,以其为模板分段扩增后拼接获得麦洼牦牛TLR1基因编码区序列,采用相关分析软件对基因进行序列分析,并对其编码的蛋白质进行基本理化性质分析及预测。【结果】分段扩增获得了TLR1基因1 484bp的上游序列和823bp的下游序列,拼接后获得2 287bp的cDNA序列。TLR1基因系统进化树及同源性比对结果表明,TLR1基因极其保守,牦牛TLR1基因与黄牛、绵羊等哺乳动物遗传距离很近。预测TLR1基因含有1个2 184bp的开放阅读框,编码727个氨基酸,其编码蛋白的分子质量为83.148 7ku;预测TLR1蛋白在第500~600位氨基酸区域含有1个疏水区域,结合跨膜区预测认为该疏水区域可能是TLR1蛋白的一个跨膜区,TLR1蛋白二级结构主要以α-螺旋及自由卷曲为主。【结论】TLR1基因在高原牦牛与平原哺乳动物之间存在较高的同源性,这可能与TLR1蛋白重要的生理功能相关。

关 键 词:麦洼牦牛  TLR1基因  克隆  生物信息学分析
收稿时间:2014/2/28 0:00:00

Cloning and bioinformatics analysis of Toll-like receptor 1 gene in Maiwa yak
CHEN Ya-bing,LAN Dao-liang and HUANG Cai,et al.Cloning and bioinformatics analysis of Toll-like receptor 1 gene in Maiwa yak[J].Journal of Northwest Sci-Tech Univ of Agr and,2014,42(12):7-12.
Authors:CHEN Ya-bing  LAN Dao-liang and HUANG Cai  
Abstract:
Keywords:Maiwa yak  TLR1 gene  cloning  bioinformatic analysis
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