ssc-miR-152生物信息学及对未成熟猪睾丸支持细胞功能的分析 |
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引用本文: | 尹艳飞,彭芷云,冉茂良,陈斌,翁波.ssc-miR-152生物信息学及对未成熟猪睾丸支持细胞功能的分析[J].中国畜牧杂志,2023(9):240-249. |
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作者姓名: | 尹艳飞 彭芷云 冉茂良 陈斌 翁波 |
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作者单位: | 1. 湘西民族职业技术学院;2. 湖南农业大学动物科学技术学院 |
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基金项目: | 湖南省自然科学基金面上项目(2023JJ60247); |
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摘 要: | 为研究ssc-miR-152生物信息学特征及对未成熟猪睾丸支持细胞功能的影响,本研究通过NCBI数据库确定ssc-miR-152在猪基因组中的位置,通过MethPrimer和EMBOSS在线软件分析ssc-miR-152上游序列CpG岛,使用Netural Network Promoter Predictio和Promoter-2.0预测其启动子区域,结合AliBaba 2.1和AnimalTFDB3.0软件预测其转录因子结合位点;Clustal W软件分析ssc-miR-152在物种间的保守性,采用CCK-8、流式细胞术和实时荧光定量PCR技术检测细胞增殖、周期及凋亡情况,运用miRanda、EIMMO、TargetScan和PITA在线软件预测ssc-miR-152的靶基因并取交集,并对预测的靶基因进行GO功能及KEGG通路分析,最后利用Cytoscape构建TF-miRNA-mRNA互作网络。结果表明:ssc-miR-152位于猪12号染色体反义链的24 292 249~24 292 328位置,其转录起始位点在上游序列200 bp处,启动子范围为393~4 619,并在该范围内...
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关 键 词: | ssc-miR-152 未成熟猪睾丸支持细胞 生物信息学 功能分析 |
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