首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
     检索      

基于全基因组重测序的岔口驿马分子遗传特性研究
引用本文:李颖,刘宇,王敏,康周才让,凌遥,赵春江.基于全基因组重测序的岔口驿马分子遗传特性研究[J].中国畜牧杂志,2023(2):109-116.
作者姓名:李颖  刘宇  王敏  康周才让  凌遥  赵春江
作者单位:1. 中国农业大学动物科技学院;2. 中国农业大学马研究中心
摘    要:本研究以岔口驿马为主要研究对象,分析了其群体结构以及其与百色马、哈萨克马品种的遗传关系和受选择位点。实验采用PCA分析、系统发育树分析、ADMIXTURE分析以探明群体遗传结构和品种间的遗传关系;采用群体遗传分化指数(Fst)、核苷酸多样性(θπ)和XP-EHH 3种方法检测岔口驿马受选择位点,提取相应的基因进行富集分析。研究结果表明,在这3个马品种中,岔口驿马与哈萨克马的遗传关系更近;使用3种分析方法所筛选到的岔口驿马与百色马的候选基因有110个,岔口驿马与哈萨克马的候选基因有25个;GO和KEGG富集分析结果显示,岔口驿马与百色马的差异基因主要富集在骨骼发育通路,而岔口驿马与哈萨克马的差异基因主要富集在神经发育相关通路。本研究初步揭示了岔口驿马的遗传特性,并为岔口驿马保种选育工作提供了参考依据。

关 键 词:马遗传资源  全基因组重测序  主成分分析  系统发育树  选择信号分析
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号