基于全基因组重测序的岔口驿马分子遗传特性研究 |
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引用本文: | 李颖,刘宇,王敏,康周才让,凌遥,赵春江.基于全基因组重测序的岔口驿马分子遗传特性研究[J].中国畜牧杂志,2023(2):109-116. |
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作者姓名: | 李颖 刘宇 王敏 康周才让 凌遥 赵春江 |
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作者单位: | 1. 中国农业大学动物科技学院;2. 中国农业大学马研究中心 |
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摘 要: | 本研究以岔口驿马为主要研究对象,分析了其群体结构以及其与百色马、哈萨克马品种的遗传关系和受选择位点。实验采用PCA分析、系统发育树分析、ADMIXTURE分析以探明群体遗传结构和品种间的遗传关系;采用群体遗传分化指数(Fst)、核苷酸多样性(θπ)和XP-EHH 3种方法检测岔口驿马受选择位点,提取相应的基因进行富集分析。研究结果表明,在这3个马品种中,岔口驿马与哈萨克马的遗传关系更近;使用3种分析方法所筛选到的岔口驿马与百色马的候选基因有110个,岔口驿马与哈萨克马的候选基因有25个;GO和KEGG富集分析结果显示,岔口驿马与百色马的差异基因主要富集在骨骼发育通路,而岔口驿马与哈萨克马的差异基因主要富集在神经发育相关通路。本研究初步揭示了岔口驿马的遗传特性,并为岔口驿马保种选育工作提供了参考依据。
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关 键 词: | 马遗传资源 全基因组重测序 主成分分析 系统发育树 选择信号分析 |
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