非洲猪瘟病毒感染相关调控基因以及毒力基因初步筛选 |
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引用本文: | 丁晓艳,何久香,周晓杨,周伃欣,李晋涛.非洲猪瘟病毒感染相关调控基因以及毒力基因初步筛选[J].畜牧兽医学报,2023(7):2964-2971. |
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作者姓名: | 丁晓艳 何久香 周晓杨 周伃欣 李晋涛 |
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作者单位: | 陆军军医大学基础医学院军事生物安全教研室 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(81570497); |
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摘 要: | 本研究旨在初步筛选非洲猪瘟病毒(African swine fever virus, ASFV)感染过程中与宿主相互作用的调控基因以及毒力基因,为非洲猪瘟(African swine fever, ASF)特效药以及疫苗研发提供分子理论基础。利用GSE145954数据集和文献挖掘,分析ASFV强毒株和弱毒株感染后宿主差异表达基因;使用Metascape数据库对差异基因进行基因功能富集分析,通过交互基因检索工具(STRING)数据库建立蛋白相互作用网络,经网络拓扑结构筛选获得病毒感染宿主调控网络关键基因,随后在细胞水平筛选调控该关键基因的ASFV毒力基因。研究发现ECE1、CCL2、CTSB、SCARB2和CD14在ASFV感染单核巨噬细胞和动物全血中均明显上调,HMBS、DYNLL1、UBB、EZH2和SERPINE1则明显下调。蛋白质相互作用(PPI)分析表明,宿主UBB、CCL2、CTSB、EZH2、SERPINE1、CD14和DYNLL1为ASFV感染宿主调控网络关键基因,其中UBB占据核心地位。ASFV B119L、I215L以及MGF360-13L可抑制UBB的表达。结果提示...
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关 键 词: | 非洲猪瘟病毒 GEO数据库 蛋白相互作用 UBB 毒力分子 |
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