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基于SINE-RIPs标记的苏姜猪群体结构和遗传多样性分析
引用本文:迟诚林,倪黎纲,陶勇,陈才,周春宝,宋成义,王宵燕.基于SINE-RIPs标记的苏姜猪群体结构和遗传多样性分析[J].中国畜牧杂志,2023(2):147-154.
作者姓名:迟诚林  倪黎纲  陶勇  陈才  周春宝  宋成义  王宵燕
作者单位:1. 扬州大学动物科学与技术学院;2. 江苏农牧科技职业学院
基金项目:国家自然科学基金(31872977,32002146);;江苏省博士后科研资助计划(2021K221B);;江苏省农业科技自主创新资金[CX(19)2016];
摘    要:为了探究苏姜猪群体遗传结构与遗传多样性,本研究采用36个SINE-RIPs(SINE Retrotransposon Insertion Polymorphisms)标记检测苏姜猪育种核心群体的基因多态性,并分析群体的遗传参数,构建UPGMA(Unweightedpair Group Method Arithmeticmean)系统发育树。结果发现,苏姜猪群体中存在29个SINE-RIPs多态性,UPGMA系统发育树将苏姜猪群体分为10个家系,家系的PIC范围为0.1883~0.2371,Fst的范围为0.011 7~0.299 1,Fis的范围为-0.902 0~-0.049 3,说明苏姜猪群体存在丰富的遗传多样性,群体近交程度较低。该研究结果为苏姜猪的持续选育和开发利用提供参考依据。

关 键 词:反转录转座子插入多态  苏姜猪  SINE  群体结构
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