沙子岭猪睾丸组织发育过程中差异表达基因的筛选及注释 |
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引用本文: | 卞桥,冉茂良,陈斌,翁波.沙子岭猪睾丸组织发育过程中差异表达基因的筛选及注释[J].中国畜牧杂志,2023(2):116-123. |
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作者姓名: | 卞桥 冉茂良 陈斌 翁波 |
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作者单位: | 湖南农业大学动物科学技术学院畜禽遗传改良湖南省重点实验室 |
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摘 要: | 本研究采用RNA-seq技术对60(DS)、90(DN)、120(DT)、150(DF)日龄沙子岭猪睾丸组织进行转录测序,筛选差异表达基因并进行功能注释,从而为进一步研究猪睾丸组织发育和精子生成的分子调控机制奠定理论基础。结果表明,各文库获得的序列数量共计1 095 135 628条,164.26 GB,其中比对至猪参考基因组的序列比例为73.07%~75.64%,共有25 491条转录本,对应21 606个基因;DN VS. DS组的差异表达基因数量为1 606个,其中1 216个上调基因显著富集于40条GO项,390个下调基因显著富集于166条GO项;DT VS. DN组的差异表达基因数量为180个,其中97个下调基因显著富集于37条GO项;DF VS.DT组的差异表达基因数量为438个,其中243个下调基因显著富集于22条GO项。说明沙子岭猪睾丸组织发育过程中基因表达存在明显差异,尤其是60日龄至90日龄期间,这些差异表达基因可为进一步研究沙子岭猪睾丸组织发育和精子生成的分子机制提供参考依据。
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关 键 词: | 沙子岭猪 睾丸组织 基因 功能注释 |
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